结论前置：员工未交接工作，公司不能直接扣工资。但公司有权要求员工履行工作交接义务，并在员工因未交接工作给公司造成经济损失时，依法要求其赔偿。
一、工资支付义务与法律规定
根据《中华人民共和国劳动法》第五十条和《工资支付暂行规定》第九条，用人单位有义务按月以货币形式支付劳动者工资，且在劳动关系解除或终止时，应一次付清劳动者工资。这表明，工资支付与工作交接是两个独立的法律关系，工资支付不应以工作交接为前提。因此，公司不能因员工未交接工作而直接扣留其工资。
二、员工的工作交接义务与赔偿责任
工作交接义务：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第五十条，劳动者在离职时应当按照双方约定，办理工作交接。这是劳动者应尽的义务，以确保用人单位的业务连续性和资料完整性。
赔偿责任：
- 若员工未履行工作交接义务，导致公司遭受直接经济损失，公司有权依据《工资支付暂行规定》第十六条及劳动合同的相关约定，要求员工承担相应的赔偿责任。但赔偿的扣除需遵循法定限制，即每月扣除的部分不得超过员工当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
三、公司的正确应对措施
沟通与协商：
- 公司应首先尝试与员工进行沟通和协商，明确告知其不交接工作的后果，并鼓励其尽快完成交接。这有助于维护双方的良好关系，也可能促使员工主动配合解决问题。
完善内部管理制度：
- 公司应加强内部管理，完善离职流程和交接制度。通过制定明确的交接流程、责任划分和奖惩机制，提前预防员工离职未交接工作的问题发生。
法律途径维权：
- 如果员工拒绝配合交接工作，且给公司造成了实际损失，公司可以通过法律途径来维护自身的合法权益。这包括向法院提起诉讼或申请劳动仲裁，要求员工承担赔偿责任。但在采取法律手段前，公司应确保已收集到充分的证据来证明损失的存在和具体数额。
四、实际案例与启示
- 案例：某公司员工离职时未交接工作，导致公司重要客户资料丢失，业务受到严重影响。公司随后通过法律途径要求员工赔偿损失，并提供了相关证据。最终，法院判决员工承担部分赔偿责任。
- 启示：公司应重视工作交接的重要性，并在员工离职时明确告知其交接义务和后果。同时，公司应完善内部管理制度，确保在员工未交接工作时能够及时采取措施维护自身权益。
总结：员工未交接工作，公司不能直接扣工资。但公司有权要求员工履行工作交接义务，并在员工因未交接工作给公司造成经济损失时，依法要求其赔偿。公司应通过沟通协商、完善内部管理制度和法律途径等措施来维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。