针对您提出的“二调水浇地，三调建设用地如何办理合法手续”的问题，这实际上涉及到了土地用途变更及合法用地手续办理的流程。以下是我为您提供的详细解答：
一、理解土地调查与合法性
首先，需要明确的是，土地调查（如“二调”、“三调”）主要是查清土地利用现状及变化情况，它并不直接决定土地的合法性。即使某块地在“三调”中被调查为建设用地，但如果该建设行为没有合法的用地审批手续，那么这块地仍然属于违法用地。
二、合法用地手续办理流程
对于您提到的从水浇地（农用地）变更为建设用地的情况，通常需要按照以下步骤办理合法手续：
履行建设项目线路、位置变更审批程序：
- 如果是因为建设项目需要变更线路或位置，导致土地用途需要变更，建设单位应首先按要求履行相关审批程序。
- 这通常包括可行性研究报告批准、项目核准或初步设计批准等机关的同意。
申请农用地转用和土地征收：
- 在获得建设项目线路、位置变更审批后，建设单位需要向市、县人民政府提出农用地转用和土地征收的申请。
- 申请时需要提供相关的申报材料，如项目审批（核准）变更批复、地质灾害评估报告、压覆矿产资源评估报告等。
政府组织报批组卷并审查：
- 市、县人民政府会组织自然资源等部门完成调整用地农用地转用和土地征收报批组卷。
- 报批组卷需要经过省自然资源厅的审查，审查通过后才能报省级人民政府批准。
获得批准并公告：
- 经省级人民政府批准后，市、县人民政府会按有关程序和规定进行公告。
- 公告内容包括批准调入土地的农用地转用和土地征收，以及同意调出土地并明确监管要求等。
办理不动产登记和国土变更调查：
- 用地调整依法获批后，市、县不动产登记机构会根据用地调整批准文件等材料开展不动产注销或变更登记。
- 市、县自然资源部门会根据不动产确权登记的权属变化开展国土变更调查权属状况更新。
三、注意事项
遵守相关法律法规：
- 在办理土地用途变更手续时，必须严格遵守《中华人民共和国土地管理法》、《中华人民共和国土地管理法实施条例》等相关法律法规。
确保材料真实完整：
- 提供的申报材料必须真实、完整，不得有虚假或遗漏。否则，可能会导致审批不通过或后续的法律问题。
关注政策变化：
- 土地政策可能会随着时间和国家发展的需要而发生变化。因此，在办理手续前，建议先了解最新的政策动态和要求。
避免违法用地：
- 切勿因为“三调”调查为建设用地就认为可以随意建设。没有合法用地审批手续的建设行为仍然属于违法用地，可能会面临拆除、罚款等法律后果。
四、针对您具体情况的建议
由于您提到的是从“二调水浇地”变更为“三调建设用地”，这可能涉及到较长时间跨度的土地用途变化。在这种情况下，我建议您：
- 咨询当地自然资源部门：了解具体的政策要求和办理流程，因为不同地区可能会有不同的实施细则和规定。
- 准备相关材料：根据当地自然资源部门的要求，准备相关的申报材料，如项目审批文件、地质灾害评估报告等。
- 耐心等待审批：土地用途变更手续的办理可能需要一定的时间，请耐心等待审批结果。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时咨询。