针对您提出的“无权源建设用地怎么办理合法手续”的问题，这确实是一个涉及土地管理和法律程序的复杂问题。以下是我为您提供的详细解答：
首先，需要明确的是，无权源建设用地，即那些未经依法审批而形成的建设用地，在法律上并不具备合法身份。即使这些土地在“三调”（第三次全国国土调查）中被调查为建设用地，也并不意味着它们就自动获得了合法地位。因此，要使这些土地合法化，必须遵循一定的法律程序和规定。
一、了解土地来源和历史情况
调查土地历史：首先，需要调查该土地的历史使用情况，包括用地行为发生的时间、用途、是否涉及违法用地等。这有助于确定土地的性质和后续处理方式。
确认权属无争议：确保土地权属无争议，这是办理合法手续的前提。如果土地存在权属纠纷，需要先解决纠纷，再申请办理相关手续。
二、根据用地时间分类处理
根据用地行为发生的时间，无权源建设用地可以大致分为以下几类，并分别采取不同的处理方式：
1986年12月31日之前：如果用地行为发生在这一时间之前，可以依照原国家土地管理局发布的《确定土地所有权和使用权的若干规定》进行确权，并依照《不动产登记暂行条例》进行登记发证。
1987年1月1日至1998年12月31日之间：对于这一时间段内的用地行为，如果农民无意见且权属无争议，可以依法落实处理（处罚）措施后，按土地现状办理建设用地审批手续。此时，需要由县（市）人民政府说明用地行为发生时间及认定依据，并对真实性负责。
1999年1月1日以后：对于这一时间段及以后的用地行为，同样需要农民无意见且权属无争议，并依法落实处理（处罚）措施。然后，按照建设占用时的国土变更调查（土地变更调查）的实际地类办理建设用地审批手续。用地报批时，也需要由县（市）人民政府说明用地行为发生时间、地类及认定依据，并对真实性负责。
三、办理建设用地审批手续
准备申请材料：根据当地国土资源部门的要求，准备相关的申请材料，如用地单位申请、项目立项、规划许可证、建设用地申请表、“一书四方案”（或三、二、一方案）、建设拟征（占）地土地权属情况汇总表、权属证件、勘测定界图及土地勘测定界技术报告书、土地利用总体规划图、1:1万土地利用现状图、平面布置图等。
提交申请并等待审批：将准备好的申请材料提交给当地国土资源部门，并等待审批。审批过程中，国土资源部门可能会进行现场勘查、核实材料等工作。
获取审批决定书：如果审批通过，您将获得关于国有未利用地转为建设用地的批复或其他相关审批决定书。此时，该土地即获得了合法身份，可以用于建设活动。
四、注意事项
遵守法律法规：在办理过程中，必须严格遵守国家关于土地管理和建设用地的法律法规，确保所有行为合法合规。
积极配合调查：在国土资源部门进行调查和审批过程中，应积极配合并提供必要的协助和信息。
关注政策变化：由于土地管理和建设用地政策可能会随着时间和形势的变化而调整，因此应密切关注相关政策变化，以便及时调整处理策略。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您在办理过程中遇到任何问题或需要进一步的帮助，请随时咨询当地国土资源部门或相关法律专业人士。