在房子有房贷且有两个孩子的情况下，撰写协议需综合考虑财产分割、子女抚养及债务承担等多方面因素，以下为具体协议要点及建议：
协议类型选择
- 离婚协议：若涉及夫妻离婚，需签订离婚协议，明确房产归属、房贷承担、子女抚养权及抚养费等事项。
- 家庭财产分割协议：若不涉及离婚，仅为家庭内部财产调整，可签订家庭财产分割协议，同样需涵盖房产、房贷及子女相关事宜。
房产归属与房贷承担
- 明确房产归属：协议中应清晰写明房产归哪一方所有，或双方共同所有但各自所占份额。
- 房贷承担方式：根据房产归属，约定房贷由哪一方承担，或双方按比例分担。若房贷由一方承担，需明确另一方是否给予经济补偿及补偿方式。
- 特殊情况处理：如房贷尚未还清，需约定在房产过户或变更登记前的房贷承担责任，以及过户或变更登记的条件和时间。
子女抚养权与抚养费
- 抚养权归属：明确两个子女的抚养权归哪一方所有，或双方共同抚养但具体安排（如居住、教育等）。
- 抚养费支付：根据抚养权归属，约定非直接抚养方需支付的抚养费金额、支付方式及时间。抚养费应涵盖子女的生活费、教育费、医疗费等必要费用。
- 特殊情况调整：如子女因特殊情况（如重大疾病、教育需求等）需要额外费用，双方应协商并约定分担方式。
其他条款
- 探视权：若子女抚养权归一方所有，应约定另一方的探视权，包括探视时间、方式及频率等。
- 违约责任：明确双方违反协议约定需承担的责任，如支付违约金、赔偿损失等。
- 争议解决：约定双方因协议履行发生争议时的解决方式，如协商、调解、仲裁或诉讼等。
协议签订与生效
- 双方签字：协议需由双方签字确认，并注明签订日期。
- 公证或见证：为增强协议的法律效力，双方可选择将协议进行公证或邀请第三方见证。
- 生效条件：明确协议生效的条件，如双方办理离婚手续后生效、双方签字后即生效等。
撰写建议：
- 详细具体：协议内容应详细具体，避免模糊不清或产生歧义。
- 合法合规：协议内容应符合法律法规的规定，不得违反公序良俗或损害第三方利益。
- 公平合理：协议内容应公平合理，兼顾双方利益，避免一方过度承担责任或享受权益。
- 咨询专业人士：在撰写协议前，建议咨询专业律师或法律顾问，以确保协议的法律效力和可执行性。
注意事项：
- 协议一旦签订，即具有法律效力，双方应严格遵守。
- 若协议内容发生变更，双方应协商一致并签订书面变更协议。
- 如因协议履行发生争议，双方应首先通过协商或调解解决；协商或调解不成的，可依法向人民法院提起诉讼。