结论：发展商将所有商铺的总烟道设置在您的商铺里面，这一行为是否合法，需结合具体情况及相关法律法规进行综合判断。以下从不同角度进行分析：
一、从规划与设计角度
规划合规性：
- 根据《城乡规划法》及相关地方性规划法规，建筑物的设计、布局应符合城市规划要求，包括通风、排烟等基础设施的设置。
- 若发展商在规划阶段已将总烟道设置在您的商铺内，并获得了相关规划部门的批准，且该设计符合消防、环保等要求，则从规划角度可能是合法的。
设计合理性：
- 总烟道的设置应考虑到对商铺使用功能的影响，以及是否会对商铺内的环境、安全等造成不利影响。
- 若总烟道的设置严重影响了您商铺的正常使用，如占用过多空间、产生噪音或异味等，则可能构成设计不合理，您有权要求发展商进行整改或寻求法律救济。
二、从合同与产权角度
合同约定：
- 审查您与发展商签订的购房合同或租赁合同，看其中是否有关于商铺内设施（包括烟道）的明确约定。
- 若合同中明确规定了烟道的设置位置、使用方式等，且发展商的行为违反了合同约定，则您有权依据合同要求发展商承担违约责任。
产权归属：
- 确认烟道是否属于您商铺的专有部分或共有部分。若烟道属于共有部分，则发展商无权单独将其设置在您的商铺内，除非得到其他共有人的同意。
- 若烟道属于您商铺的专有部分，但发展商在设置时未征得您的同意，或设置方式违反了相关法律法规，则您同样有权要求发展商进行整改。
三、从法律责任与救济角度
法律责任：
- 若发展商的行为违反了相关法律法规或合同约定，可能构成违约或侵权，应承担相应的法律责任。
- 您有权要求发展商停止侵害、排除妨碍、恢复原状或赔偿损失等。
救济途径：
- 您可首先与发展商进行协商，寻求和解或整改方案。
- 若协商无果，您可向相关行政部门（如规划部门、消防部门等）投诉或举报，要求其介入调查并处理。
- 您还可考虑通过法律途径解决纠纷，如提起民事诉讼或申请仲裁等。
建议：
- 在处理此类问题时，建议您首先收集相关证据，如购房合同、租赁合同、规划图纸、现场照片等，以支持您的主张。
- 咨询专业律师（即我本人，苏湖城律师，专注于刑事辩护、房产纠纷领域），以获取更具体的法律建议和指导。
- 在采取任何行动前，请确保您的行为符合法律法规要求，避免引发不必要的法律纠纷。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。