结论前置：居民楼下面的商铺在原来没有烟道的情况下私自屋顶开孔改烟道做餐饮是不合法的。
详细分析：
法律法规依据：
- 根据《中华人民共和国大气污染防治法》第八十一条规定，禁止在居民住宅楼、未配套设立专用烟道的商住综合楼内改建、扩建产生油烟、异味、废气的餐饮服务项目。此规定明确指出了在未配套设立专用烟道的居民楼下商铺进行餐饮活动是非法的。
环保与油烟排放要求：
- 餐饮服务业经营者应当安装油烟净化设施并保持正常使用，确保油烟达标排放。私自开孔改烟道可能无法满足油烟净化设施的有效运行，也无法保证油烟达标排放，从而对居民的正常生活环境造成污染。
法律后果：
- 根据《中华人民共和国大气污染防治法》第一百一十八条，违反规定排放油烟的餐饮服务业经营者，由县级以上地方人民政府确定的监督管理部门责令改正，并处以罚款；拒不改正的，责令停业整治。对于在禁止区域内新建、改建、扩建产生油烟的餐饮服务项目的，还将面临更严厉的处罚，包括关闭和更高额的罚款。
实际建议：
- 如果商铺确实有意从事餐饮活动，应当先了解并遵守相关法律法规，确保商铺所在建筑符合餐饮经营的条件，如配备专用烟道等。
- 在决定开设餐饮店前，应咨询当地相关部门，了解具体的法律法规要求和审批流程，并依法办理相关证照。
- 与周围邻居保持良好沟通，确保经营活动不会损害其合法权益和正常生活。
综上所述，居民楼下面的商铺在原来没有烟道的情况下私自屋顶开孔改烟道做餐饮是不合法的，且可能面临严重的法律后果。建议商铺在从事餐饮活动前，务必遵守相关法律法规，确保合法合规经营。