周六加班扣全勤是否合法，这主要取决于公司的规章制度以及劳动合同中的相关约定，但单纯以周六加班为由扣除全勤奖，通常是不合理的。下面我将从几个方面为你详细分析：

1. 加班工资与全勤奖的性质：

   • 加班工资是劳动者在法定工作时间以外提供劳动所应得的报酬，这是法律明确规定的。
   • 全勤奖则是公司为了鼓励员工按时出勤而设立的一种奖励制度，其发放条件通常与员工的出勤情况直接相关。

2. 周六加班与全勤奖的关系：

   • 周六加班是劳动者为公司提供了额外的劳动，按照法律规定，公司应当支付加班工资。
   • 全勤奖的发放应当基于员工是否满足公司规定的出勤条件，而不是是否加班。如果员工因为公司安排而加班，这并不应成为扣除全勤奖的理由。

3. 公司规章制度与劳动合同的约定：

   • 公司可以在规章制度中规定全勤奖的发放条件，但这些条件必须合法、合理，且不得与法律法规相抵触。
   • 劳动合同是劳动者与用人单位之间确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。如果劳动合同中明确规定了加班不影响全勤奖的发放，那么公司就不能以加班为由扣除全勤奖。

4. 加班工资的计算：

   • 根据《山东省企业工资支付规定》等相关法律法规，加班工资的计算基数应为劳动者本人上月工资扣除加班费后的应发工资数额。
   • 周六加班，如果不能安排补休，公司应当按照不低于日或者小时工资基数的200%支付加班工资。具体计算公式为：周六加班工资 = 月工资基数 ÷ 21.75天（月计薪天数）× 200% × 加班天数。

5. 可能的法律后果：

   • 如果公司以周六加班为由扣除全勤奖，且这一做法没有合法依据，那么劳动者有权向公司提出异议，并要求公司补发全勤奖。
   • 如果公司拒绝补发，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉，或者通过劳动仲裁、诉讼等法律途径维护自己的合法权益。

建议：

• 首先，你可以查看公司的规章制度和劳动合同，了解全勤奖的发放条件和加班工资的计算方式。
• 如果发现公司存在不合理扣除全勤奖的情况，你可以与公司进行沟通协商，要求公司补发全勤奖。
• 如果沟通无果，你可以向当地劳动监察部门投诉，或者寻求法律援助，通过法律途径维护自己的权益。

希望以上分析能对你有所帮助。如果你还有其他问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。