关于周六不加班扣全勤奖是否合理的问题，结论前置如下：
一般情况下，未经协商的不加班扣除全勤奖可能构成违法：根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，加班需与工会和劳动者协商一致，且不得违反每日及每月的加班时间限制。全勤奖作为对正常出勤的奖励，不应因劳动者拒绝未经协商的加班而被扣除。
特殊情况下或公司有合法且明确规定时，扣除可能具有合理性：在存在自然灾害、事故等紧急情况，或生产设备故障等必须及时抢修的情形时，用人单位可以不受加班时间限制的安排加班。若劳动者无正当理由拒绝加班，且公司规章制度或劳动合同中明确规定了在此类情况下扣除全勤奖的条款，且该条款不违反法律法规，则扣除可能具有合理性。
详细分析如下：
加班的法律规定：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第四十一条，用人单位因生产经营需要加班，需与工会和劳动者协商一致，且每日加班一般不得超过一小时，特殊情况下不得超过三小时，每月不得超过三十六小时。这表明，劳动者有权拒绝未经协商的加班要求。
全勤奖的性质与扣除条件：
- 全勤奖是公司内部制定的一种奖励制度，旨在鼓励员工正常出勤。其发放条件和标准应由公司规章制度或劳动合同明确规定。若公司规章制度或劳动合同中未明确规定“不加班就扣除全勤奖”，或者该规定违反了法律法规（如侵犯了劳动者的合法权益），则公司不能随意扣除员工的全勤奖。
特殊情况下的加班与全勤奖扣除：
- 在《中华人民共和国劳动法》第四十二条规定的特殊情况下，如发生自然灾害、事故或生产设备故障等，用人单位可以不受加班时间限制的安排加班。若劳动者无正当理由拒绝加班，且公司规章制度或劳动合同中明确规定了在此类情况下扣除全勤奖的条款，且该条款合法、公平、公正，则扣除可能具有合理性。但即便如此，公司也应确保扣除的合理性，避免过度侵犯劳动者的权益。
劳动者的权益保护：
- 若劳动者认为公司不合理地扣除了全勤奖，应首先与公司进行沟通协商，要求其纠正违法行为。若协商不成，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
建议与行动指南：
对于劳动者：
- 了解自己的合法权益，包括加班的规定和全勤奖的发放条件。
- 若公司扣除全勤奖，首先与公司沟通协商，要求提供合理的解释和依据。
- 若协商无果，及时向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
对于用人单位：
- 制定合法、公平、公正的规章制度和劳动合同条款，明确全勤奖的发放条件和扣除标准。
- 在安排加班时，确保与工会和劳动者协商一致，并遵守加班时间限制。
- 在特殊情况下需要加班时，确保有合法且明确的规章制度支持，并避免过度侵犯劳动者的权益。
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