针对您提出的“残疾人被单位叫去等待上级检查发生意外，如何认定工伤”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确工伤认定的基本条件。根据《工伤保险条例》的相关规定，职工在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害的，应当认定为工伤。这是工伤认定的核心原则。

接下来，我们分析您描述的具体情况：

1. 工作时间和工作场所：残疾人被单位叫去等待上级检查，这一行为发生在工作时间内，且是在单位的工作场所内进行的。这符合工伤认定中“工作时间和工作场所”的要求。

2. 工作原因：等待上级检查是单位安排的工作任务之一，属于工作范畴。因此，因等待检查而发生的意外，可以视为因工作原因受到的事故伤害。

基于以上分析，如果残疾人在等待上级检查的过程中发生了意外，且该意外与等待检查这一工作任务直接相关，那么根据《工伤保险条例》的规定，这种情况应当被认定为工伤。

申请工伤认定的流程：

1. 准备材料：

   • 工伤认定申请表：详细填写事故发生的时间、地点、原因以及职工伤害程度等基本情况。
   • 与用人单位存在劳动关系的证明材料：如劳动合同、工资单、工作证等。如果未签订劳动合同，可以参照工资支付凭证或记录、工作证、招工登记表、考勤记录及其他劳动者证言等证据来确定事实劳动关系。
   • 医疗诊断证明：由医疗机构出具的关于职工受伤情况的诊断证明。

2. 提交申请：

   • 职工或其近亲属、工会组织应在事故伤害发生之日起一定期限内（通常为30日内，如果单位未提出申请，则职工或其近亲属、工会组织可在1年内提出）向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。

3. 审核与认定：

   • 社会保险行政部门会对提交的材料进行审核，并根据实际情况进行调查核实。
   • 如果材料齐全且符合工伤认定的条件，社会保险行政部门会作出工伤认定的决定，并书面通知申请工伤认定的职工或者其近亲属和该职工所在单位。

特殊情况处理：

• 如果单位不为职工申请工伤，且没有证人，职工或其近亲属、工会组织仍然可以自行提出工伤认定申请。职工所在单位是否同意（签字、盖章）不是必经程序。
• 如果对工伤认定结论有争议，可以依法申请行政复议或向人民法院提起行政诉讼。

综上所述，如果残疾人在等待上级检查的过程中因工作原因发生意外，且符合工伤认定的条件，那么应当被认定为工伤。职工或其近亲属、工会组织应按照规定的流程准备材料并提交工伤认定申请。