核心结论：针对工资10000元但合同仅写3000元的情况，需分情况处理，关键在于证明实际工资与合同约定不符，并依法主张权益。以下是具体分析：

1. 合同效力与实际履行不一致

• 合同条款的效力：劳动合同中约定的工资条款（如3000元）若低于实际发放的工资（10000元），属于“阴阳合同”或“部分无效条款”。根据《劳动合同法》第26条，以欺诈、胁迫手段订立的合同或违反法律强制性规定的条款无效。若能证明实际工资为10000元，合同中关于工资的条款可能被认定无效。
• 实际履行的优先性：根据《最高人民法院关于审理劳动争议案件适用法律问题的解释（一）》第43条，用人单位与劳动者虽未书面变更劳动合同，但已实际履行口头变更的劳动合同超过一个月，且变更内容不违反法律、行政法规的，变更后的内容对双方具有约束力。因此，若长期按10000元发放工资，可主张实际工资为10000元。

2. 如何证明实际工资为10000元

• 关键证据：
  1. 工资条/银行流水：显示每月实际到账金额为10000元（需注明“工资”或“代发工资”）。
  2. 个税申报记录：用人单位代扣代缴个人所得税的申报基数（应与10000元一致）。
  3. 同事证言：同岗位同事的工资证明（需注意证人出庭作证的风险）。
  4. 沟通记录：与用人单位协商工资的邮件、微信、录音等（需明确提及工资数额）。
  5. 其他福利证明：如奖金、补贴、社保缴费基数（需与10000元匹配）。
• 注意事项：证据需形成完整链条，避免单一证据不足。例如，仅有银行流水但无工资条，可能被用人单位以“报销款”“借款”等理由抗辩。

3. 可能涉及的法律风险与应对

• 用人单位主张“合同工资为基本工资”：若合同中约定“3000元为基本工资，其余为绩效/奖金”，需审查绩效/奖金的发放条件是否合理。若用人单位无法证明绩效/奖金的考核标准或未实际考核，可主张全部工资为固定工资。
• 经济补偿金/赔偿金的计算基数：若发生劳动争议（如违法解除、未足额支付工资等），经济补偿金/赔偿金的计算基数应为实际工资（10000元），而非合同工资（3000元）。根据《劳动合同法实施条例》第27条，经济补偿的月工资按劳动者应得工资计算，包括计时工资、计件工资、奖金、津贴和补贴等货币性收入。
• 社保缴费基数不足：若用人单位按3000元缴纳社保，可向社保部门投诉要求补缴，但需注意补缴可能涉及滞纳金，且个人需承担部分费用。

4. 建议行动步骤

1. 收集证据：优先整理工资条、银行流水、个税申报记录等直接证据。
2. 与用人单位协商：书面要求用人单位出具工资说明或补签协议，明确实际工资为10000元。
3. 申请劳动仲裁：若协商无果，可向劳动仲裁委员会申请仲裁，主张：

    - 确认实际工资为10000元；
    - 补发工资差额（如用人单位曾按3000元发放）；
    - 调整社保缴费基数；
    - 其他相关诉求（如经济补偿金）。
   

4. 咨询专业律师：劳动争议案件程序复杂，建议委托律师代理，以提高胜诉率。

总结：合同工资与实际工资不一致时，劳动者可通过证据证明实际履行情况，并依法主张权益。关键在于固定证据、明确诉求，必要时通过法律途径解决。如有进一步问题，可直接向我咨询。