结论：工资差异是否可以认为是约定的，需根据具体情况来判断，主要看两份合同的真实性、合法性以及双方的实际履行情况。
分析说明：
合同真实性：
- 如果两份合同都是双方真实意思的表示，且没有违反法律法规的强制性规定，那么这两份合同都是有效的。在这种情况下，如果一份合同约定的工资低，另一份约定的工资高，且双方都按照高工资的合同实际履行了，那么工资差异就可以认为是双方约定的。
- 如果其中一份合同存在欺诈、胁迫等情形，导致该合同并非双方真实意思的表示，那么这份合同可能被认定为无效或可撤销。此时，工资差异就不能简单地认为是双方约定的，而需要根据实际情况和法律规定来判断。
合同合法性：
- 劳动合同的内容必须符合法律法规的规定，包括工资标准、工作时间、休息休假等。如果其中一份合同约定的工资低于当地最低工资标准，那么这份合同中关于工资的部分就是违法的，无效的。在这种情况下，工资差异就不能被认定为双方约定的合法部分。
- 如果两份合同都符合法律法规的规定，且没有违反公序良俗，那么工资差异在合法范围内是可以被认定为双方约定的。
实际履行情况：
- 即使两份合同都真实且合法，但如果双方在实际履行过程中并没有按照高工资的合同来执行，而是按照低工资的合同来支付工资，那么工资差异就不能被认为是双方约定的。因为实际履行情况是判断合同是否得到执行的重要依据。
- 如果双方都按照高工资的合同实际履行了，包括工资的支付、社保的缴纳等，那么工资差异就可以认为是双方约定的，且在实际操作中得到了执行。
法律建议：
- 如果你与公司之间存在两份劳动合同，且工资存在差异，建议你先仔细审查这两份合同的真实性、合法性以及双方的实际履行情况。
- 如果确认两份合同都是真实且合法的，且双方都按照高工资的合同实际履行了，那么你可以认为工资差异是双方约定的。但为了确保自己的权益，建议你保留好相关的证据，如工资条、银行转账记录等。
- 如果对合同的真实性、合法性或实际履行情况存在疑问，或者与公司之间就工资差异产生了纠纷，建议你及时向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律意见和帮助。
后续行动：
- 在处理此类问题时，务必保持冷静和理性，不要因为情绪而做出冲动的决定。
- 及时收集并保存好相关证据，以便在需要时能够证明自己的权益。
- 如果与公司之间的协商无法解决问题，可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。