结论：离职后药店扣押药师证且自己没有直接证据的情况下，您仍然可以通过多种途径来维护自己的合法权益，包括收集间接证据、与药店协商、向相关部门投诉以及提起法律诉讼等。

详细分析：

1. 收集间接证据：

   • 尽管您可能没有直接证据证明药店扣押了您的药师证，但您可以尝试收集其他间接证据来支持您的主张。例如，您可以回忆并记录与药店沟通的过程，包括时间、地点、参与人员以及沟通内容等。如果可能的话，找到当时的同事或目击者作为证人，他们的证言可能对您的案件有所帮助。
   • 另外，您还可以检查自己的邮箱、短信或社交媒体等，看是否有与药店沟通关于药师证归还的记录。这些记录虽然可能不是直接证据，但可以作为辅助证据来支持您的主张。

2. 与药店协商：

   • 在收集到一定证据后，您可以尝试与药店进行协商，要求其归还您的药师证。在协商过程中，您可以明确表达自己的诉求和理由，并尝试达成一个双方都能接受的解决方案。
   • 如果药店同意归还药师证，建议您要求药店出具书面证明或签署和解协议，以确保自己的权益得到保障。

3. 向相关部门投诉：

   • 如果与药店协商无果，您可以向当地的药监部门或劳动监察部门投诉药店的违法行为。在投诉时，您需要提供详细的证据和情况说明，以便相关部门能够了解事情的真相并作出处理。
   • 相关部门在接到投诉后，会进行调查并依法处理药店的违法行为。如果药店确实存在扣押药师证的行为，相关部门会责令其归还并可能对其进行处罚。

4. 提起法律诉讼：

   • 如果以上途径均无法解决问题，您可以考虑向法院提起法律诉讼，要求药店归还药师证并赔偿因此造成的损失。在提起诉讼前，您需要准备好相关证据和材料，并咨询专业律师的意见以确保自己的诉求得到支持。
   • 在诉讼过程中，您需要按照法院的要求提供证据和进行辩论。如果法院最终判决药店归还药师证并赔偿损失，药店必须履行判决义务。

法律建议：

• 在处理此类纠纷时，建议您保持冷静和理性，不要采取过激行为或言语攻击药店。相反，您应该通过合法途径来维护自己的权益。
• 如果您对法律程序不熟悉或担心自己的权益无法得到保障，可以寻求专业律师的帮助。律师可以为您提供法律咨询、代理诉讼等服务，帮助您更好地维护自己的合法权益。

可能后果：

• 如果药店确实存在扣押药师证的行为，并且您能够提供足够的证据来支持自己的主张，那么药店可能会面临法律制裁和赔偿损失的责任。
• 如果您无法提供足够的证据来支持自己的主张，或者药店能够提供合理的解释和证据来反驳您的主张，那么您可能需要承担一定的诉讼风险和成本。因此，在提起诉讼前，请务必谨慎考虑并咨询专业律师的意见。