结论：协议中“不能追究公积金，违反十倍补偿”的条款是否有效，需分情况讨论，关键看条款是否违反法律强制性规定、是否显失公平或存在其他无效情形。以下分情况具体说明：

1. 若公积金缴纳属于法定强制义务，相关条款可能无效

根据《住房公积金管理条例》规定，用人单位必须为员工缴纳住房公积金，这是法定义务，不得通过协议免除。若协议中“不能追究公积金”的条款试图排除这一义务，则因违反法律强制性规定而无效。此时，员工仍有权要求单位补缴公积金，且“十倍补偿”的约定因基础条款无效而无法律依据，单位无需履行。

2. 若公积金缴纳非法定强制义务（如特殊用工形式），条款效力需结合其他因素判断

若双方属于非全日制用工、退休返聘等特殊关系，且当地政策未强制要求缴纳公积金，则“不能追究公积金”的条款可能有效。但“十倍补偿”的约定需满足以下条件才有效：

• 双方自愿协商：补偿标准需是双方真实意思表示，无欺诈、胁迫等情形；
• 不显失公平：补偿金额需与实际损失或违约责任相当，若十倍补偿明显过高（如远超公积金本金及利息），可能因显失公平被法院调整或认定无效；
• 不违反公序良俗：若补偿条款带有惩罚性或恶意，可能被认定为无效。

3. 若条款存在其他无效情形，整体或部分无效

即使公积金缴纳非强制义务，若协议存在以下情形，相关条款仍可能无效：

• 以合法形式掩盖非法目的：如单位通过“十倍补偿”威胁员工放弃公积金权利；
• 恶意串通损害第三方利益：如单位与员工串通逃避税务或社保监管；
• 格式条款未提示说明：若“不能追究公积金”属于格式条款，单位未履行提示或说明义务，员工可主张该条款不成为合同内容。

实务建议

1. 员工角度：若单位未缴公积金，可先向当地住房公积金管理中心投诉，要求单位补缴；若协议条款限制权利，可主张条款无效并要求补缴。
2. 单位角度：避免通过协议免除法定义务，补偿条款需合理且符合法律规定，否则可能面临行政处罚或诉讼风险。

如有具体协议内容或案件细节，可进一步向我咨询，我会结合实际情况为您详细分析。