结论：公司扣生育津贴期间的工资这一做法一般是不合法的，但具体还需结合实际情况判断。以下从不同角度为你详细分析：

法律背景与规定

• 生育津贴的性质：生育津贴是国家法律、法规规定对职业妇女因生育而离开工作岗位期间，给予的生活费用。其目的是保障女职工在生育期间的基本生活需求，是对女职工生育权益的一种重要保障。
• 工资与生育津贴的关系：根据相关规定，女职工在产假期间，享受生育津贴的，用人单位不得再额外支付工资，但生育津贴低于女职工产假前工资标准的，由用人单位予以补足。也就是说，生育津贴和工资在某种程度上是“替代”关系，而不是叠加关系。但如果女职工在产假期间未享受生育津贴，或者生育津贴不足以覆盖其产假前工资标准，用人单位则应当按照法律规定支付工资。
• 关于未休假正常上班的情况：如果女职工在人流后实际未休假而正常上班，这并不改变其应享受的生育津贴待遇。生育津贴是基于女职工的生育事实而给予的，与是否实际休假无关。同时，女职工正常上班期间，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定支付工资。

公司扣工资的合法性分析

• 一般情况不合法：在女职工人流后实际未休假而正常上班的情况下，公司扣生育津贴期间的工资是没有法律依据的。生育津贴是女职工应得的福利，而工资是女职工提供劳动后应得的报酬，两者不能相互抵消或剥夺。
• 特殊情况需考虑：当然，也存在一些特殊情况。比如，如果公司与女职工在劳动合同或相关协议中有明确约定，在特定情况下（如未休假而正常上班）可以调整生育津贴或工资的支付方式，且这种约定不违反法律法规的强制性规定，那么公司可能有一定的合理性依据。但这种情况较为少见，且需要严格的合同条款和法律依据支持。

法律建议与后果

• 法律建议：如果你遇到公司扣生育津贴期间工资的情况，首先应当与公司进行沟通协商，明确表达自己的权益和诉求。如果协商无果，你可以向当地的劳动保障监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
• 可能的法律后果：如果公司确实存在违法行为，劳动保障监察部门或劳动仲裁机构可能会责令公司限期支付工资、生育津贴差额等费用，并可能对公司处以罚款等行政处罚。同时，你还有权要求公司支付经济补偿金等额外费用。

进一步思考：在实际操作中，每个案件的具体情况都有所不同。因此，在处理类似纠纷时，建议你尽可能收集相关证据（如劳动合同、工资单、生育津贴发放记录等），以便更好地维护自己的权益。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。