公司扣生育津贴是违法的，员工有权依法维护自己的合法权益。以下是对此问题的详细分析：

一、生育津贴的法律性质与支付规定

根据《女职工劳动保护特别规定》第八条和《中华人民共和国社会保险法》第五十六条，生育津贴是国家为保障职业妇女因生育离开工作岗位期间的生活而设立的费用。具体支付规定如下：

1. 已参加生育保险的情况：生育津贴由生育保险基金支付给用人单位，随后用人单位应按时、足额地将此津贴发放给女职工本人。这是女职工因生育而暂时中断劳动期间的经济补偿，是其合法的社会保障待遇。
2. 未参加生育保险的情况：若用人单位未为女职工参加生育保险，则需按照女职工产假前工资的标准直接支付产假工资，这实际上承担了生育保险基金的支付责任。在此情况下，用人单位同样无权扣下生育津贴（即产假工资）。

二、公司扣生育津贴的违法性分析

公司扣生育津贴的行为，无论是否已参加生育保险，均可能构成违法：

1. 已参加生育保险：若公司扣下生育津贴，未按照社保部门核定的金额全额支付给员工，或以各种理由扣除一部分，均违反了生育津贴的支付规定，侵犯了女职工的合法权益。
2. 未参加生育保险：若公司未为员工缴纳生育保险，且在员工产假期间未按照正常出勤的工资标准发放工资，而是扣发生育津贴，同样构成违法。

三、员工如何维护自己的合法权益

若公司扣下了员工的生育津贴，员工可通过以下途径来维护自己的合法权益：

1. 与公司协商：首选方式是与公司进行友好协商，明确表达要求支付生育津贴的意愿，并尝试了解扣押的原因，通过沟通寻求解决方案。
2. 申请调解或仲裁：若协商无果，员工可以向劳动争议调解委员会提出调解请求，或直接向劳动争议仲裁委员会提起仲裁申请。在仲裁过程中，员工需提供相关证据以支持自己的主张，如身份证原件及复印件、劳动合同、生育相关证明材料（如准生证、出生证明）、生育津贴发放记录（如单位通知、银行流水明细）等。
3. 提起诉讼：如果对仲裁结果不满意，员工有权向人民法院提起诉讼。在诉讼中，员工需进一步举证证明公司扣下生育津贴的事实，法院将依据法律规定作出公正判决。

四、注意事项

1. 保留证据：在整个维权过程中，员工应保留好所有与生育津贴相关的证据材料，以便在需要时提供。
2. 了解法律：员工应充分了解自己的法律权利，包括生育津贴的支付规定、维权途径等，以便在必要时采取适当措施维护自身利益。
3. 理性维权：在维权过程中，员工应保持冷静和理性，遵循法律程序，避免采取过激行为。

综上所述，公司扣生育津贴是违法的，员工应依法维护自己的权益。通过了解法律依据、采取适当的维权步骤并保留必要证据，员工有望成功追回被扣留的生育津贴。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。