合同工因病不能上班，核心处理方式需依据劳动合同约定、公司规章制度及劳动法律法规综合判断，具体分以下情况处理：

1. 医疗期内的权利保障

根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，劳动者因病或非因工负伤停止工作治病休息时，用人单位不得解除劳动合同，且需支付病假工资。

• 医疗期时长：根据工龄和在本单位工作年限确定，一般为3-24个月（例如：实际工作10年以下、本单位工作5年以下的为3个月）。
  
• 病假工资标准：不得低于当地最低工资标准的80%，具体比例可能因地区或公司制度调整。
  
• 操作建议：
  
  • 及时向公司提交医院出具的病假证明（如诊断书、休假建议单）；
    
  • 保留就医记录、缴费凭证等证据，避免公司以“旷工”为由解除合同。

2. 医疗期满后的处理

若医疗期满后仍无法从事原工作，用人单位需根据《劳动合同法》第四十条处理：

• 调整岗位：公司可安排劳动者从事力所能及的其他工作，工资待遇可协商调整；
  
• 解除合同：若劳动者不能从事新岗位，公司需提前30日书面通知或支付1个月工资代通知金，并支付经济补偿（按工作年限，每满1年支付1个月工资）。
  
• 操作建议：
  
  • 主动与公司沟通康复情况，争取合理调整岗位；
    
  • 若公司违法解除合同（如未支付补偿、未履行通知程序），可申请劳动仲裁要求赔偿。

3. 特殊情形：职业病或工伤

若因工作原因患病（如职业病）或受伤，适用《工伤保险条例》：

• 工伤认定：需在30日内由公司申请，或劳动者在1年内自行申请；
  
• 待遇保障：包括医疗费、停工留薪期工资（原工资福利不变）、伤残补助等；
  
• 操作建议：
  
  • 立即要求公司申请工伤认定，保留事故现场证据；
    
  • 若公司拒绝，可自行向社保部门申请并投诉。

4. 公司违法行为的应对

若公司存在以下行为，劳动者可维权：

• 拒不支付病假工资或医疗期工资；
  
• 以“旷工”为由违法解除合同；
  
• 未依法缴纳社保导致无法享受医保待遇。
  
• 维权途径：
  
  • 向当地劳动监察大队投诉（快速处理）；
    
  • 申请劳动仲裁（需提交劳动合同、病假证明、工资记录等证据）。

总结：合同工因病不能上班时，首先确认医疗期时长及工资标准，及时提交病假证明；医疗期满后配合公司调整岗位或协商解除合同；若涉及工伤或职业病，立即申请认定；遭遇公司违法行为时，通过投诉或仲裁维权。具体操作需结合劳动合同、公司制度及地方规定，如有疑问可进一步向我咨询细节。