当员工因交通事故受伤并被认定为工伤时，关于保险公司赔付误工费后单位是否还要发工资的问题，我们可以从以下几个方面进行详细解答：
一、核心结论
即使员工已经获得交通事故赔付的误工费，公司仍然需要支付其停工留薪期间的工伤工资。 这是因为交通事故赔偿与工伤赔偿是两个独立的法律体系下的赔偿项目，它们之间并不冲突，也不能相互替代。
二、法律依据及原理
性质区别：
- 交通事故赔偿是基于侵权责任，旨在弥补受害人因交通事故所遭受的损失，包括误工费，这是对受害人因无法正常工作导致的收入减少的补偿。
- 工伤赔偿则是基于劳动关系，是职工因工作原因受到事故伤害后依法享受的工伤保险待遇。其中，停工留薪期工资是用人单位对工伤职工在停工治疗期间应享受的工资福利待遇的保障。
相关法律规定：
- 根据《工伤保险条例》第三十三条，职工因工作遭受事故伤害需暂停工作接受治疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。
- 同时，根据相关司法解释，职工因工伤事故遭受人身损害，且因第三人侵权造成的损害，赔偿权利人可同时请求工伤保险待遇和民事侵权赔偿。
三、具体实践情况
兼得模式（双赔）：
- 在大多数情况下，除医疗费用等少数不能重复赔偿的项目外，职工可以同时获得交通事故侵权赔偿和工伤赔偿。误工费和停工留薪期工资在性质和功能上不同，不存在重复赔偿问题。前者是对交通事故导致的收入损失的赔偿，后者是用人单位对工伤职工的工资福利保障。
- 例如，若职工在上班途中发生交通事故并认定为工伤，且对方负主要责任，那么职工在获得交通事故责任方赔付的误工费后，公司仍应按原工资福利待遇标准支付其停工留薪期工资。
特殊情况：
- 在极少数地区或特定情况下，可能采取补充模式。即若职工已从交通事故侵权方获得误工费赔偿，且该金额高于或等于职工本人工资标准，用人单位可能不再支付或补足差额部分的停工留薪期工资。但这种情况需根据当地具体法律法规确定，且并非普遍现象。
四、单位发工资与保险公司赔偿义务的独立性
- 单位是否继续发工资与保险公司是否需要赔偿误工费是两个独立的问题。单位的工资发放是基于其与员工的劳动关系及内部规定，而保险公司的赔偿则是基于保险合同和相关的法律规定。
- 因此，即使单位在员工受伤期间继续发放工资，这并不影响员工根据工伤保险规定享受停工留薪期工资的权利，也不影响员工根据交通事故侵权责任获得误工费赔偿的权利。
五、建议与注意事项
- 对于员工而言，应保留好相关证据，如工资发放证明、银行流水、医疗证明等，以便在需要时证明自己的实际收入减少情况。
- 若遇到单位或保险公司拒绝支付相关费用的情况，员工可咨询专业的法律人士以获取更具体的建议和指导，必要时可通过法律途径维护自己的合法权益。
综上所述，交通事故赔付的误工费与工伤工资的支付是两个独立的法律体系下的赔偿项目。员工因交通事故获得的误工费赔偿，不影响其同时享受工伤保险待遇的权利。因此，即使员工已获得交通事故的误工费赔付，公司仍需按照工伤保险的规定支付其在停工留薪期间的工伤工资。