在职务犯罪退赔过程中，受贿的房子被没收后，其价值通常会在总赃款中予以扣除。以下是对此问题的详细分析：

1. 法律原则与退赔机制：

   • 根据我国《刑法》及相关司法解释，职务犯罪中的退赔是指犯罪嫌疑人或被告人将其非法所得的财物退还给国家或受害者，以减轻或消除其犯罪行为所造成的损害。
   • 在退赔过程中，对于非法所得的财物，如房产、车辆等，通常会根据其市场价值进行评估，并在总赃款中予以扣除。这是为了确保退赔的公正性和合理性，避免对犯罪嫌疑人或被告人造成双重处罚。

2. 房产没收与价值扣除：

   • 当受贿的房子被没收时，该房产作为非法所得的一部分，其价值应当被计入总赃款中。然而，在退赔过程中，由于该房产已经被没收并归国家所有，因此其价值通常会在总赃款中予以扣除。
   • 扣除房产价值后，剩余的赃款部分将由犯罪嫌疑人或被告人继续退赔。如果剩余赃款无法全部退赔，犯罪嫌疑人或被告人可能还需要承担其他法律责任，如罚金、没收财产等。

3. 实际操作中的注意事项：

   • 在实际操作中，房产的价值评估需要由专业的评估机构进行，以确保评估结果的公正性和准确性。
   • 犯罪嫌疑人或被告人应当积极配合退赔工作，提供必要的证据和资料，以便准确评估房产价值并顺利完成退赔程序。
   • 如果犯罪嫌疑人或被告人对房产价值评估结果有异议，可以依法申请重新评估或提出其他合法诉求。

4. 特殊情况下的处理：

   • 在某些特殊情况下，如房产价值难以评估、房产存在权属纠纷等，可能会影响房产价值的扣除和退赔工作的进行。此时，需要根据具体情况进行灵活处理，并可能需要借助法律程序来解决争议。

建议：如果您或您身边的人涉及职务犯罪退赔问题，特别是涉及房产没收和价值扣除的情况，建议及时咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。作为专注于刑事辩护、职务犯罪领域的律师，我可以为您提供专业的法律帮助和解答。