疫情期间公司停工停产，给员工发基本工资在一定条件下是合法的。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据与合法性分析
《工资支付暂行规定》第十二条：
- 非因劳动者原因造成单位停工、停产在一个工资支付周期内的，用人单位应按劳动合同规定的标准支付劳动者工资。这意味着，如果停工停产时间未超过一个工资支付周期（通常为一个月），公司应按照劳动合同约定的标准向员工支付工资，包括基本工资和可能的绩效奖金等。此时，仅发放基本工资可能构成违法，除非劳动合同中明确约定了基本工资即为全部工资。
- 超过一个工资支付周期的，若劳动者提供了正常劳动，则支付给劳动者的劳动报酬不得低于当地的最低工资标准；若劳动者没有提供正常劳动，用人单位应当按照不低于当地最低工资标准的70%或80%（具体比例根据地方规定）支付劳动者基本生活费。在这种情况下，如果公司发放的基本工资不低于当地政策规定的基本生活费标准，那么仅发放基本工资是合法的。
人力资源社会保障部等七部门《关于妥善处置涉疫情劳动关系有关问题的意见》：
- 该意见鼓励协商解决复工前的用工问题，并指出对因受疫情影响职工不能按期到岗或企业不能开工生产的，企业应主动与职工沟通，协商优先使用带薪年休假、企业自设福利假等各类假。这进一步体现了在疫情期间，企业与员工应通过协商来解决问题，包括工资待遇的调整。
二、特殊情况考虑
企业与员工的协商：
- 在疫情期间，企业与员工可以通过协商的方式就工资待遇进行调整。如果双方达成一致，即使调整后的工资待遇低于原劳动合同约定的标准，也是合法的。因此，如果公司能够与员工就发放基本工资达成一致，那么这种做法是合法的。
员工实际工作情况：
- 如果员工在停工停产期间提供了正常劳动（如远程办公），那么公司应按照劳动合同约定的标准或双方协商确定的标准向员工支付工资。此时，仅发放基本工资可能不合法，除非双方有特别约定或劳动合同中有相关规定。
三、实际操作建议
公司应明确停工停产的时间和原因：
- 公司应明确告知员工停工停产的具体时间和原因，以便员工了解自己的权益和公司的义务。
公司应与员工进行充分沟通：
- 在调整工资待遇前，公司应与员工进行充分沟通，解释调整的原因和依据，并尽量达成一致意见。
公司应遵守当地政策规定：
- 公司应了解并遵守当地关于停工停产期间工资支付的政策规定，确保员工的合法权益得到保障。
总结来说，疫情期间公司停工停产给员工发基本工资是否合法，取决于停工停产的时间、员工是否提供正常劳动以及双方是否达成一致意见等因素。如果公司能够遵守相关法律法规和政策规定，并与员工进行充分沟通达成一致意见，那么这种做法是合法的。如果公司存在违法行为或未与员工达成一致意见，员工有权向当地劳动保障部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。如有更多疑问，可以直接向我咨询。