综合工时制下超出工时的部分，确实可以安排调休，但具体安排需遵循相关法律法规及政策规定。以下是对此问题的详细分析：
一、综合工时制的基本概念
综合工时制，是指用人单位因生产特点不能实行标准工时制，经劳动行政部门批准，对特定岗位的员工实行以周、月、季或年为周期综合计算工作时间的一种工时制度。在综合工时制下，员工的工作时间可能因生产需要而有所波动，但平均每周或每月的工作时间应不超过法定标准。
二、超出工时的调休规定
调休原则：
- 根据《劳动法》及相关规定，综合工时制下超出标准工作时间的部分，用人单位应首先考虑安排员工调休，以保障员工的休息权。
调休方式：
- 调休通常应在下一个综合计算周期内进行，即如果以周为周期，则应在下一周内安排调休；如果以月、季或年为周期，则应在相应的周期内安排。
- 调休的具体时间应由用人单位与员工协商确定，并尽量满足员工的合理需求。
无法调休时的处理：
- 如果因生产需要无法安排调休，用人单位应按照法律规定支付加班费。加班费的计算标准通常根据员工的小时工资和超出的小时数来确定。
三、实际操作中的注意事项
合同约定：
- 用人单位与员工在劳动合同中应明确约定综合工时制的具体安排，包括工作时间的计算方式、调休政策等。
审批程序：
- 实行综合工时制需经劳动行政部门批准，用人单位应确保已获得相关审批，并严格按照审批内容执行。
员工权益保护：
- 用人单位应尊重员工的休息权，合理安排工作时间和调休，避免过度加班对员工身心健康造成影响。
- 员工也有权拒绝不合理的加班要求，并可以向劳动监察部门投诉用人单位的违法行为。
四、法律后果
- 如果用人单位未按照法律规定安排调休或支付加班费，员工有权向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，要求用人单位承担相应的法律责任。
- 劳动监察部门或劳动仲裁机构将根据事实和法律规定，对用人单位的违法行为进行查处，并保障员工的合法权益。
建议：在实际操作中，用人单位应建立健全的工时管理制度，明确综合工时制的具体安排和调休政策，确保员工的休息权得到充分保障。同时，员工也应了解自己的权益和义务，积极维护自己的合法权益。如果您在综合工时制或调休方面遇到任何问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。