结论：麻将馆作弊被发现后，老板不能直接以此为由拒绝支付相关费用（如赌资、服务费等），但具体处理方式需根据作弊行为的性质、双方约定以及相关法律法规综合判断。以下从不同角度进行分析：
一、从合同关系角度分析
服务合同关系：
- 若麻将馆与顾客之间存在服务合同关系（如提供麻将桌、场地等），老板通常无权因顾客作弊而直接拒绝支付服务费。服务费的支付是基于服务合同的约定，与顾客是否作弊无直接关联。
- 例外情况：如果服务合同中明确约定，顾客作弊将视为违约，老板有权拒绝支付服务费或要求顾客承担违约责任，那么老板可以依据合同条款行事。
赌资支付问题：
- 麻将馆本身若涉及赌博活动，则赌资的支付问题可能涉及违法。在我国，赌博是违法的，因此赌资不受法律保护。老板不能因顾客作弊而主张赌资的合法性或拒绝支付（实际上，赌资本身就不应被支付或追讨）。
- 合法经营前提：如果麻将馆是合法经营，仅提供娱乐场所，不涉及赌博，那么顾客之间的赌资支付属于私人行为，与麻将馆老板无关。老板无权干涉顾客之间的赌资支付问题。
二、从作弊行为性质角度分析
作弊行为的违法性：
- 作弊行为本身可能构成欺诈或违反公序良俗。如果作弊行为严重到构成犯罪（如诈骗罪），则作弊者将面临刑事责任。
- 民事责任：即使作弊行为不构成犯罪，作弊者也可能因欺诈行为而承担民事责任，如赔偿损失等。但这与麻将馆老板是否支付费用无直接关联。
老板的权利与义务：
- 老板作为麻将馆的经营者，有义务提供安全、公平的娱乐环境。如果发现顾客作弊，老板可以采取合理措施制止作弊行为，如要求作弊者离开麻将馆、报警等。
- 无权直接拒付：然而，老板无权直接因顾客作弊而拒绝支付相关费用（除非合同中有明确约定）。老板可以通过法律途径追究作弊者的责任，但不能擅自扣留或拒绝支付费用。
三、法律建议与后果
法律建议：
- 对于麻将馆老板而言，如果发现顾客作弊，应首先采取合理措施制止作弊行为，并保留相关证据（如监控录像、证人证言等）。
- 如果作弊行为严重，老板可以报警处理，让公安机关依法处理作弊者。
- 对于费用支付问题，老板应依据合同约定和法律规定来处理。如果合同中有明确约定，可以依据合同条款行事；如果没有约定或约定不明确，应通过协商或法律途径解决。
可能的法律后果：
- 如果老板擅自扣留或拒绝支付费用，可能构成违约或侵权行为，需要承担相应的法律责任（如赔偿损失、支付违约金等）。
- 如果作弊行为构成犯罪，作弊者将面临刑事责任；同时，麻将馆老板如果明知作弊行为而未采取合理措施制止或报告公安机关，也可能承担一定的法律责任（如行政处罚或刑事责任，具体取决于作弊行为的性质和老板的过错程度）。
总结：麻将馆作弊被发现后，老板不能直接以此为由拒绝支付相关费用。老板应依据合同约定和法律规定来处理费用支付问题，并采取合理措施制止作弊行为。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。