结论：合同中建议明确写明开票税率及实际收取的税率情况，以避免后续可能产生的纠纷。以下从不同角度进行分析：

1. 从合同明确性角度
   合同作为双方权利义务的书面载体，其核心功能之一就是明确约定各项交易细节，以避免后续争议。若合同中未明确写明开票税率（如13个点）与实际收取税率（如10个点）的差异，可能导致以下风险：
   

• 税务合规风险：税务机关可能对发票开具与合同约定不符的情况进行核查，若无法合理解释差异，可能被认定为虚开发票或偷逃税款，引发行政处罚甚至刑事责任。
  
• 合同履行争议：若一方主张按合同约定税率开票，另一方主张按实际收取税率履行，可能因约定不明产生纠纷，需通过诉讼或仲裁解决，增加维权成本。
  因此，建议在合同中明确写明“甲方应向乙方开具税率为13%的增值税专用发票，但乙方实际仅需按10%的税率支付款项”，以固定双方真实意思表示。

1. 从税务处理角度
   根据《增值税暂行条例》及实施细则，纳税人销售货物或提供应税劳务时，应按实际税率开具发票。若合同约定税率与实际税率不一致，需注意以下操作要点：
   

• 发票开具：卖方应按实际交易内容（如货物或服务）对应的税率开具发票，而非单纯按合同约定税率。例如，若实际交易适用13%税率，则应开具13%发票，但可通过合同条款约定买方仅需支付10%的款项，剩余3%由卖方承担或通过其他方式处理。
  
• 账务处理：双方需在账务中清晰记录税率差异的原因（如商业折扣、补贴等），并确保符合税法规定。例如，若10%为不含税价，13%为含税价，需在合同中明确价税分离条款，避免重复计税或漏税。
  建议：在合同中增加“价税分离”条款，明确不含税价、税率及价税合计金额，例如：“不含税价为XX元，税率为13%，价税合计为XX元，但乙方仅需支付XX元（即不含税价+10%税款）”。

1. 从商业风险角度
   若合同未明确税率差异，可能因政策变动（如税率调整）或一方履约能力变化导致风险：
   

• 政策变动风险：若合同履行期间税率下调（如从13%降至11%），未明确约定的合同可能引发双方对是否调整价款的争议。
  
• 履约能力风险：若一方因财务困难无法按约定税率履行，可能通过主张合同无效或变更来规避责任。
  建议：在合同中增加“税率调整条款”，明确若税率变动，双方应按新税率协商调整价款或履行方式，以降低不确定性。

总结：合同中明确写明开票税率与实际收取税率的差异，既是税务合规的要求，也是避免合同纠纷的必要措施。若您有进一步疑问或需要起草/审查合同，可直接向我咨询，我将结合具体交易背景为您提供专业建议。