员工辞职时，工资应当一次性付清。这一结论主要基于以下法律背景和具体分析：
法律依据
根据《中华人民共和国劳动法》第五十条：“工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。”以及《工资支付暂行规定》第九条：“劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。”这些规定明确了用人单位在员工离职时有义务一次性结清工资。
具体分析
正常离职情况：
- 员工按照公司规定的流程提出辞职申请，并完成工作交接等手续后，用人单位应当在办理完离职手续的同时，一次性支付员工的全部工资。这包括员工当月的工资以及可能存在的未结清的奖金、提成等。
- 例如，员工在月底最后一天离职，用人单位应在当天或次月初的工资发放日（若公司有固定的工资发放日且该日早于离职日后的合理期限），将员工当月的工资及未结清款项一并支付。但严格从法律意义上讲，应在离职时即行支付。
特殊离职情况（如即时解除劳动合同）：
- 如果用人单位存在未及时足额支付劳动报酬、未依法为劳动者缴纳社会保险费等违法行为，员工有权依据《劳动合同法》第三十八条的规定，立即解除劳动合同，并要求用人单位一次性支付所有工资及经济补偿金。
- 在这种情况下，用人单位同样需要在员工离职时一次性付清工资，不得有任何拖延。
协商一致的情况：
- 虽然法律有明确规定，但如果用人单位与员工就工资支付时间达成了一致意见，例如约定在某个特定日期支付（且该日期在离职后的合理期限内），那么只要这种约定不违反法律法规的强制性规定，就是有效的。
- 但即便如此，也建议双方在协议中明确支付时间和方式，以避免后续纠纷。同时，员工应确保该约定不会损害自己的合法权益。
实际操作建议
- 员工方面：在离职时，应了解自己的权益，并要求用人单位按照法律规定一次性结清工资。如果用人单位未能按时支付，可以先与用人单位进行协商解决；若协商无果，可以向当地的劳动监察部门进行投诉举报，或者依法向当地人民法院申请支付令来维护自己的合法权益。
- 用人单位方面：应严格遵守法律规定，确保在劳动合同终止时及时一次性结清员工的工资。这不仅可以避免不必要的法律纠纷和损失，还可以维护公司的良好形象和信誉。
综上所述，员工辞职时工资应当一次性付清是法律规定的明确要求。如果你在离职过程中遇到任何关于工资支付的问题或纠纷，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律帮助。