结论前置：员工辞职时，工资原则上应一次性付清，但具体情形可能因实际情况和双方约定而有所不同。以下是对此问题的详细解析：

一、法律规定需一次性结清的情形

根据《工资支付暂行规定》第九条：“劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。”这一规定明确了在劳动关系解除或终止时，用人单位有义务一次性结清劳动者的工资。无论是员工主动辞职，还是因用人单位原因导致劳动合同解除，这一原则均适用。

举例说明：

• 员工A因个人原因提前30天提交书面辞职申请，并完成工作交接。在离职当天，公司应一次性结清A的工资，包括当月工资及可能存在的未结清奖金、提成等。
• 员工B因用人单位未及时足额支付劳动报酬，依据《劳动合同法》第三十八条的规定立即解除劳动合同。此时，用人单位同样需要在B离职时一次性付清工资及经济补偿金。

二、特殊情况或约定情形的处理

尽管法律有明确规定，但在实际操作中，也可能存在一些特殊情况或用人单位与劳动者之间的特别约定：

1. 特殊情况：

   • 如企业遭遇不可抗力因素（如自然灾害、疫情等）导致资金周转困难，确实无法立即一次性结清工资时，用人单位应与劳动者协商一致，并征得劳动者本人同意后，可以在一定期限内分期支付工资。但这种情况必须严格按照法律规定的程序操作，且仅为一种特殊的例外情形。

2. 约定情形：

   • 如果用人单位与劳动者在劳动合同或规章制度中明确约定了工资结算的方式和时间，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么双方可以按照约定执行。然而，即使有这样的约定，也不能违背在合理期限内支付工资的原则。如果约定的支付时间过长，严重损害了劳动者的合法权益，这种约定可能会被认定为无效。

举例说明：

• 员工C与公司在劳动合同中约定，离职后工资在次月工资发放日支付。若该约定不违反法律法规，且双方均同意，则可按此约定执行。但若公司拖延至数月后才支付，则可能构成违法。

三、员工违法或违反公司规定的处理

如果员工因违法或严重违反公司规定而被开除，用人单位可能会根据公司的相关规定和劳动合同的约定，扣除部分工资作为赔偿。但这种扣除必须合法合规，不能随意克扣劳动者工资。用人单位应确保扣除的金额和理由均符合法律法规的规定，并保留相关证据以备查证。

四、离职时的结算沟通与维权途径

为避免后续产生纠纷，劳动者在离职时应与用人单位明确工资结算的方式和时间。如果用人单位未按照法律规定或约定一次性结清工资，劳动者可以通过以下途径维护自己的权益：

1. 与用人单位协商：首先尝试与用人单位沟通，了解工资未结清的原因，并协商解决方案。
2. 向劳动监察部门投诉：若协商无果，可向当地劳动监察部门投诉，由劳动监察部门责令用人单位限期支付。
3. 申请劳动仲裁：若问题仍未解决，可申请劳动仲裁，通过法律程序要求用人单位支付工资及可能的赔偿金。

总结：员工辞职时，工资原则上应一次性付清。但在特殊情况下，如企业遭遇不可抗力或双方有特别约定时，可能允许一定程度的协商或延迟。无论如何，用人单位都应确保在合理期限内完成工资支付，以维护劳动者的合法权益。若遇到工资未结清的情况，劳动者应积极通过合法途径维护自己的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。