在合同纠纷中，若一方否认签名是其本人签名，通常应由否认签名的一方申请鉴定，但具体情形需结合案件实际情况判断。以下从不同角度为你详细分析：

一、一般原则：否认签名方承担初步举证责任，通常由其申请鉴定

在民事诉讼中，谁主张、谁举证是基本原则。当一方否认合同上的签名是其本人所签时，该方即提出了一个主张（即签名非本人所签），因此需要承担初步的举证责任。为了证明其主张，否认签名的一方通常会申请对签名进行笔迹鉴定，以通过科学手段确认签名是否为其本人所签。

举例说明：假设甲和乙签订了一份合同，但甲否认合同上的签名是其本人所签。在此情况下，甲为了证明其主张，可能会向法院申请对合同上的签名进行笔迹鉴定。

二、特殊情形：若否认签名方能提供初步证据，可能由对方申请鉴定或双方共同委托

虽然否认签名的一方通常承担申请鉴定的责任，但在某些特殊情形下，如果否认签名方能够提供初步证据（如证人证言、视频资料等）表明签名可能非其本人所签，或者对方对签名真实性无异议但法院认为有必要进行鉴定时，也可能由对方申请鉴定或双方共同委托鉴定。

举例说明：假设甲否认合同上的签名是其本人所签，并提供了监控视频显示在合同签订时其并不在现场。在此情况下，如果乙坚持认为签名是甲所签，但无法提供反驳证据，法院可能会认为有必要进行笔迹鉴定，此时可能由乙申请鉴定或双方共同委托鉴定。

三、法律建议：及时申请鉴定并保留相关证据

1. 及时申请鉴定：如果否认签名的一方认为签名非其本人所签，应及时向法院申请笔迹鉴定，以避免因拖延时间而导致证据灭失或鉴定难度增加。
2. 保留相关证据：在申请鉴定的同时，否认签名的一方应保留好与签名相关的所有证据，如合同原件、监控视频、证人证言等，以便在鉴定过程中或诉讼中提供有力的支持。
3. 关注鉴定程序：在鉴定过程中，否认签名的一方应关注鉴定程序的合法性和公正性，确保鉴定结果的真实性和可靠性。如果认为鉴定程序存在瑕疵或鉴定结果不公正，可以及时向法院提出异议或申请重新鉴定。

四、可能的法律后果

1. 如果鉴定结果支持否认签名方的主张：即签名非其本人所签，那么合同对该方可能不产生法律效力（具体需结合合同内容和其他证据判断），该方可能无需承担合同约定的义务或责任。
2. 如果鉴定结果不支持否认签名方的主张：即签名是其本人所签，那么该方需要承担合同约定的义务或责任，并可能因否认签名而承担一定的法律后果（如赔偿对方因鉴定产生的费用等）。

在处理此类纠纷时，建议根据具体情况及时咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。如果你有任何合同纠纷方面的法律问题，都可以直接向我咨询。