在追诉时效问题上，若按旧法已经过了追诉期，但按新法仍在追诉期内，应当适用新法的规定进行追诉。以下是对这一问题的详细分析：

一、追诉时效的基本原则

追诉时效是刑法规定的一项重要制度，它设定了对犯罪分子进行刑事追究的有效期限。这一制度的设立，旨在促使司法机关及时行使职权，提高司法效率，并考虑证据可能灭失、被告人的改造情况等因素。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，追诉时效的期限根据犯罪的法定最高刑来确定，具体分为四个档次：

1. 法定最高刑为不满五年有期徒刑的，经过五年不再追诉；
2. 法定最高刑为五年以上不满十年有期徒刑的，经过十年不再追诉；
3. 法定最高刑为十年以上有期徒刑的，经过十五年不再追诉；
4. 法定最高刑为无期徒刑、死刑的，经过二十年不再追诉。如果二十年以后认为必须追诉的，须报请最高人民检察院核准。

二、新旧法交替时的追诉时效适用

当新旧刑法在追诉时效上存在差异时，即按旧法已经过了追诉期，但按新法仍在追诉期内，应当如何适用法律呢？

1. 从旧兼从轻原则：在刑法领域，有一个重要的原则叫做“从旧兼从轻”。这意味着，在一般情况下，应当适用行为时的法律（即旧法）。但是，如果新法不认为是犯罪或者处刑较轻时，则应当适用新法。然而，这一原则主要适用于犯罪行为的定性以及刑罚的轻重，对于追诉时效的适用，并不直接适用“从旧兼从轻”原则。

2. 追诉时效的独立性：追诉时效是刑法规定的一项独立制度，它不受犯罪行为发生时法律的影响。也就是说，无论犯罪行为发生时法律如何规定追诉时效，都应当按照现行有效的法律来确定追诉时效。因此，在新旧法交替的情况下，如果按旧法已经过了追诉期，但按新法仍在追诉期内，那么应当适用新法的规定进行追诉。

三、特殊情况下的追诉时效

当然，也存在一些特殊情况，可能会影响追诉时效的适用。例如：

1. 立案后不受追诉时效限制：根据《中华人民共和国刑法》第八十八条的规定，在人民检察院、公安机关、国家安全机关立案侦查或者在人民法院受理案件以后，逃避侦查或者审判的，不受追诉期限的限制。这意味着，如果案件已经立案，并且犯罪嫌疑人存在逃避侦查或审判的行为，那么无论时间过去多久，司法机关都有权对其进行追诉。

2. 被害人控告后不受追诉时效限制：同样根据《中华人民共和国刑法》第八十八条的规定，被害人在追诉期限内提出控告，人民法院、人民检察院、公安机关应当立案而不予立案的，也不受追诉期限的限制。这体现了法律对被害人权益的特殊保护。

四、建议与总结

1. 对于犯罪嫌疑人：如果面临追诉时效的问题，应当及时了解现行法律的规定，并咨询专业律师的意见。同时，应当积极配合司法机关的调查，避免逃避侦查或审判的行为，以免加重自己的法律责任。

2. 对于司法机关：在处理新旧法交替时的追诉时效问题时，应当严格依照现行有效的法律来确定追诉时效。同时，也应当注意案件的特殊情况，如立案后逃避侦查或审判、被害人控告后不予立案等，这些情况可能会影响追诉时效的适用。

综上所述，当按旧法已经过了追诉期，但按新法仍在追诉期内时，应当适用新法的规定进行追诉。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。