企业在特殊时期是否可以停休，以及是否合法，这主要取决于具体的法律法规、劳动合同的约定以及企业的实际情况。以下从几个方面进行详细分析：

1. 法律法规层面：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，劳动者享有休息休假的权利。企业应当保证劳动者每周至少休息一日，并且按照国家规定安排劳动者休假。在特殊时期，如疫情期间，虽然企业可能面临经营困难，但并不能因此剥夺劳动者的休息休假权利。
   • 如果企业因特殊原因需要安排劳动者加班或调整休息休假安排，应当与劳动者协商一致，并依法支付加班费或安排补休。未经劳动者同意，企业不得单方面强制劳动者加班或取消休息休假。

2. 劳动合同约定层面：

   • 劳动合同是劳动者与用人单位之间确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。如果劳动合同中明确约定了劳动者的休息休假安排，企业应当遵守合同约定，不得随意变更。
   • 在特殊时期，如果企业需要调整劳动者的休息休假安排，应当与劳动者进行协商，并达成一致意见。如果劳动者不同意变更合同，企业应当尊重劳动者的意愿，不得强制执行。

3. 企业实际情况层面：

   • 在特殊时期，如疫情期间，企业可能面临生产停滞、订单减少等经营困难。为了应对这些困难，企业可能需要采取一些措施来降低成本、保持运营。然而，这些措施应当合法合规，不得侵犯劳动者的合法权益。
   • 如果企业确实需要安排劳动者在特殊时期工作或调整休息休假安排，应当充分考虑劳动者的身体状况、家庭情况等因素，并依法支付相应的劳动报酬和福利待遇。

可能存在的法律后果：

• 如果企业未经劳动者同意，单方面强制劳动者加班或取消休息休假，可能构成违法行为。劳动者有权向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，要求企业承担相应的法律责任。
• 如果企业因特殊原因需要调整劳动者的休息休假安排，但未与劳动者协商一致或未依法支付加班费等劳动报酬，也可能面临法律纠纷和赔偿责任。

建议：

• 在特殊时期，企业应当加强与劳动者的沟通协商，共同应对经营困难。如果需要调整劳动者的休息休假安排，应当提前与劳动者进行协商，并达成一致意见。
• 企业应当遵守相关法律法规和劳动合同约定，保障劳动者的合法权益。如果确实需要采取一些特殊措施来应对经营困难，应当确保这些措施合法合规，并充分考虑劳动者的利益和感受。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。