当被辞职的员工选择将单位告上法庭时，这通常涉及到劳动争议，特别是关于劳动合同解除的合法性及赔偿问题。以下是一些详细的步骤和建议，帮助单位应对此类情况：

一、理解劳动争议的核心

首先，要明确劳动争议的核心在于劳动合同的解除是否合法，以及单位是否需要支付违法解除劳动合同的赔偿金。员工可能会主张单位违法解除劳动合同，要求支付赔偿金；而单位则可能主张解除劳动合同是合法的，无需支付赔偿金。

二、回顾解除劳动合同的过程

1. 审查解除决定：回顾单位作出解除劳动合同决定的过程，包括是否有充分的理由、是否遵循了内部程序（如通知工会、进行调查等）、是否有书面记录等。

2. 分析解除理由：确保解除劳动合同的理由符合《中华人民共和国劳动法》及相关法律法规的规定，如员工严重违反公司规章制度、严重失职造成重大损失等。

3. 检查通知程序：确认单位是否按照法律规定向员工发出了书面的解除劳动合同通知，并保留了送达的证据。

三、准备应诉材料

1. 收集证据：收集与解除劳动合同相关的所有证据，包括但不限于员工违纪记录、调查报告、解除劳动合同通知、送达证据等。

2. 准备答辩状：根据员工的诉讼请求，准备详细的答辩状，阐述单位解除劳动合同的合法性及无需支付赔偿金的理由。

3. 准备相关法律法规：收集并整理与劳动争议相关的法律法规，以便在法庭上引用。

四、应对法庭审理

1. 积极应诉：按时出庭，积极配合法庭的审理工作，如实陈述事实，提供证据。

2. 反驳员工主张：针对员工的主张，逐一进行反驳，提供相反的证据或理由。

3. 强调合法解除：重点强调单位解除劳动合同的合法性，包括解除理由的充分性、程序的合规性等。

五、参考类似案例

可以参考类似案例的判决结果，了解法院在处理类似劳动争议时的倾向和原则。例如，在“被‘口头开除’后离岗，他状告公司为何败诉?”的案例中，法院认为口头开除并非真实意思表示，不产生法律意义上的民事法律行为后果，因此驳回了员工的诉讼请求。这提示单位在解除劳动合同时，必须确保程序的合规性和通知的正式性。

六、寻求专业法律帮助

如果单位对劳动争议的处理不够熟悉或感到困惑，建议寻求专业法律帮助。律师可以提供专业的法律意见，帮助单位制定应诉策略，提高胜诉的可能性。

七、预防未来争议

为了避免未来类似的劳动争议，单位应加强内部管理，完善规章制度，确保解除劳动合同的程序合规、理由充分。同时，加强与员工的沟通，及时解决员工的问题和诉求，营造和谐的劳动关系。

总之，当被辞职的员工选择将单位告上法庭时，单位应积极应对，准备充分的证据和材料，强调解除劳动合同的合法性，并在必要时寻求专业法律帮助。同时，单位也应加强内部管理，预防未来类似的劳动争议。