长期不在公司上班的股东发工资是否合法，需根据具体情况来判断，不能一概而论。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 无劳动关系且无特殊约定的情况

   • 结论：若股东仅为出资人，不参与公司经营管理，也未提供实质性劳动，且公司章程或股东之间无特别约定，则公司不应为其发放工资。
   • 法律依据：
     • 《中华人民共和国劳动法》第五十条：工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这表明工资的支付对象应为提供了劳动的劳动者。
     • 《工资支付暂行规定（1994年版）》第三条：本规定所称工资是指用人单位依据劳动合同的规定，以各种形式支付给劳动者的工资报酬。说明工资是基于劳动合同下劳动者提供的劳动而获得的报酬。
   • 分析：在此情况下，股东未与公司形成劳动关系，也未提供劳动，因此不符合工资支付的条件。若公司擅自发放工资，可能被视为不合理支出或股东分红，需按税法规定处理，并可能引发税务风险。

2. 存在劳动关系的情况

   • 结论：若股东在公司担任董事、监事、高级管理人员等职务，或从事其他具体工作，与公司形成劳动关系，则公司应按其职务和工作内容支付相应工资。
   • 法律依据：
     • 《中华人民共和国劳动合同法》第三十条：用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。
   • 分析：在此情况下，股东作为劳动者，享有获得劳动报酬的权利。公司应根据其职务和工作内容，按照劳动合同约定和国家规定支付工资。

3. 有特殊约定或公司章程规定的情况

   • 结论：若公司章程有特别规定，或股东之间有明确且合法的约定（如为激励股东长期持股而给予的补贴），在特定条件下即使股东不上班也可获得一定报酬。
   • 分析：这种报酬并非传统意义上的工资，而是基于公司章程或股东之间的特别约定。其性质、支付方式和金额等需依据公司章程和相关法律规定来确定，并确保报酬的合理性与合法性。例如，若为激励股东长期持股而给予的补贴，可能需符合税法规定，并作为股东的其他收入进行税务处理。

建议与风险提示：

• 公司应严格遵守法律法规和劳动合同约定，确保工资支付的合理性与合法性。在处理股东工资问题时，应仔细审查股东在公司中的角色、是否提供劳动、是否有合法有效的约定或规定等因素。
• 股东应明确自己在公司中的身份和权利，避免混淆股东权利与工资支付。若股东同时担任公司职务，应与公司签订劳动合同，明确职务、工作内容和工资待遇等事项。
• 若公司或股东对工资支付问题存在疑问或争议，建议及时咨询专业律师，以获取准确指导并避免法律风险。

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