结论前置：

1. 用人单位在劳动合同到期后三个月续签，从法律条文直接规定来看，并不直接合法，因为法律通常规定了一个月的宽限期来续签劳动合同。
2. 但若双方协商一致，且合同内容合法，实际中可能被视为双方对原合同期限的延长或新合同的达成，不过这存在法律风险，建议尽量在一个月内续签。

详细分析：

首先，我们需要明确的是，根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，当劳动合同期满时，如果劳动者继续在用人单位工作，用人单位应当在劳动合同期满次日起一个月内与劳动者续订书面劳动合同。这一规定为用人单位提供了一个月的宽限期来办理续签手续，在此期间内续签劳动合同，用人单位不会面临支付双倍工资等违法风险。

从法律条文直接规定来看：

• 劳动合同到期后，用人单位应在一个月内与劳动者续签劳动合同。如果超过这个期限，用人单位可能会面临支付双倍工资等法律责任。因此，从严格意义上讲，用人单位在劳动合同到期后三个月才续签，并不直接符合法律的规定。

从实际协商和合同内容合法性角度考虑：

• 尽管法律有明确规定，但在实际操作中，如果双方协商一致，且合同内容合法、公平，那么即使超过了一个月的时间续签，也可能被视为双方对原合同期限的延长或者新合同的达成。不过，这种做法存在法律风险，因为一旦发生纠纷，用人单位可能需要承担举证责任，证明双方确实协商一致，并且合同内容合法。

法律建议：

• 为了避免法律风险，用人单位应尽量在劳动合同到期后一个月内与劳动者续签劳动合同。如果确实需要更长时间来协商或准备续签手续，建议与劳动者进行充分沟通，并达成书面协议，明确双方的权利和义务，以及续签的时间节点。
• 同时，用人单位在续签劳动合同时，应确保合同内容合法、公平，充分保障劳动者的合法权益。这包括但不限于明确工作内容、工作时间、劳动报酬、社会保险等关键条款。

可能的法律后果：

• 如果用人单位未在劳动合同到期后一个月内与劳动者续签劳动合同，且无法证明双方协商一致延长合同期限或达成新合同，那么用人单位可能需要支付双倍工资等法律责任。此外，如果因此引发劳动纠纷，用人单位还可能面临劳动仲裁或诉讼等法律程序，增加企业的运营成本和法律风险。

综上所述，虽然从法律条文直接规定来看，用人单位在劳动合同到期后三个月续签并不直接合法，但若双方协商一致且合同内容合法，实际中可能被视为双方对原合同期限的延长或新合同的达成。不过，为了避免法律风险，建议用人单位尽量在一个月内续签劳动合同。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。