医院工作人员违反“两非”（非医学需要的胎儿性别鉴定和选择性别人工终止妊娠）工作规定的处理方式，需根据具体违法情形、情节严重程度及造成的后果，结合行政、刑事及内部纪律处分等多维度综合判定。具体分析如下：

1. 行政处罚
   根据《人口与计划生育法》《母婴保健法》及《禁止非医学需要的胎儿性别鉴定和选择性别人工终止妊娠的规定》等法律法规，医院工作人员若实施或参与“两非”行为，卫生健康行政部门可依法对其作出行政处罚，包括：

   • 警告、罚款：对直接负责的主管人员和其他直接责任人员，可处以警告、没收违法所得，并处以罚款（具体金额根据违法情节确定，如《禁止非医学需要的胎儿性别鉴定和选择性别人工终止妊娠的规定》中规定，组织、介绍他人实施“两非”的，可处以2万元以上5万元以下罚款）；
     
   • 吊销执业证书：对参与“两非”的医务人员，可依法吊销其医师执业证书或母婴保健技术考核合格证书；
     
   • 暂停执业活动：情节较轻的，可责令暂停6个月以上1年以下执业活动。

2. 刑事责任
   若“两非”行为情节严重，构成犯罪的，依法追究刑事责任。常见罪名包括：

   • 非法行医罪：若工作人员未取得医师资格或超出执业范围实施“两非”行为，可能触犯《刑法》第336条，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或单处罚金；严重损害就诊人健康的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；造成就诊人死亡的，处十年以上有期徒刑，并处罚金；
     
   • 非法进行节育手术罪：若工作人员为他人进行非医学需要的胎儿性别鉴定或选择性别人工终止妊娠，情节严重的，可能触犯《刑法》第336条第二款，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或单处罚金；严重损害就诊人健康的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；
     
   • 其他关联犯罪：如“两非”行为涉及伪造、变造、买卖国家机关公文、证件、印章，或受贿、行贿等，可能同时构成其他犯罪，需数罪并罚。

3. 内部纪律处分
   医院作为用人单位，可依据内部规章制度对涉事工作人员进行纪律处分，包括：

   • 警告、记过、降级、撤职、开除：根据违法情节及医院规定，给予相应处分；
     
   • 解除劳动合同：若行为严重违反医院规章制度或职业道德，医院可依法解除劳动合同，且无需支付经济补偿。

4. 其他责任

   • 民事赔偿：若“两非”行为导致患者人身损害，患者可依法要求医院及涉事工作人员承担民事赔偿责任；
     
   • 行业禁入：部分地区可能对实施“两非”的医务人员实施行业禁入措施，限制其未来从事相关医疗活动。

建议：若您或您所在的医院涉及“两非”相关问题，建议立即停止违法行为，主动配合卫生健康行政部门的调查，并咨询专业律师评估法律风险，制定应对策略。如有进一步疑问，可直接向我咨询。