结论：在买卖合同中约定以房产抵顶百分之五十货款，而出卖人主张以现金付款的纠纷中，法院的判决会基于合同的具体内容、双方当事人的真实意思表示以及相关法律法规进行综合判断。以下是对此问题的详细分析：

一、合同内容与双方真实意思表示

1. 合同条款的明确性：首先，法院会审查买卖合同中关于以房产抵顶货款的条款是否明确、具体。如果合同中明确约定了以特定房产抵顶百分之五十的货款，并且该条款不违反法律法规的强制性规定，那么该条款通常是有效的。

2. 双方当事人的真实意思：法院还会考虑双方当事人在签订合同时的真实意思表示。如果出卖人在签订合同时明确表示同意以房产抵顶货款，并且在合同履行过程中没有提出异议，那么其事后主张以现金付款可能难以得到法院的支持。

二、相关法律法规的适用

1. 《民法典》关于合同履行的规定：根据《民法典》的相关规定，当事人应当按照约定全面履行自己的义务。如果合同中明确约定了以房产抵顶货款，那么出卖人应当按照约定履行，除非双方协商一致变更合同内容或者存在其他法定变更、解除合同的情形。

2. 房产抵顶货款的法律性质：以房产抵顶货款实际上是一种债务清偿方式，即出卖人通过转让房产的所有权来抵销其应支付的货款。这种清偿方式在法律上是允许的，只要双方当事人达成合意且不违反法律法规的强制性规定。

三、法院可能的判决结果

1. 支持以房产抵顶货款：如果合同条款明确、双方当事人真实意思表示一致，且不存在其他法定变更、解除合同的情形，法院可能会判决支持以房产抵顶货款的约定，驳回出卖人以现金付款的主张。

2. 考虑其他因素：然而，如果合同条款存在模糊之处、双方当事人对合同内容存在争议，或者存在其他影响合同履行的因素（如房产无法过户、房产价值显著低于货款等），法院可能会综合考虑这些因素，对判决结果进行适当调整。例如，法院可能会判决出卖人支付部分现金，同时以房产抵顶剩余货款；或者判决解除合同，并要求出卖人返还已收取的货款及赔偿损失等。

四、建议与注意事项

1. 明确合同条款：为了避免类似纠纷的发生，建议在签订买卖合同时明确约定以房产抵顶货款的具体条款，包括房产的详细信息、抵顶货款的金额、过户时间等。

2. 保留相关证据：在合同履行过程中，双方当事人应当保留好与合同履行相关的证据，如房产过户手续、货款支付凭证等，以便在发生纠纷时能够证明自己的主张。

3. 及时咨询专业律师：如果双方当事人在合同履行过程中发生争议，建议及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，并根据律师的建议采取相应的法律措施。

最后，如果您在买卖合同中遇到类似纠纷，或者有任何其他法律问题，都可以直接向我咨询。我会根据您的具体情况，为您提供专业、全面的法律建议。