结论：公司把治疗费从工伤赔偿里扣除的做法通常是不合理的。
法律背景与解释：
工伤赔偿的构成：
- 根据《工伤保险条例》及相关法律法规，工伤赔偿通常包括医疗费、停工留薪期工资、护理费、一次性伤残补助金、一次性工伤医疗补助金和一次性伤残就业补助金等多个部分。
- 医疗费是工伤赔偿中明确列出的一项，用于支付工伤职工因治疗工伤而产生的合理医疗费用。
治疗费与工伤赔偿的关系：
- 治疗费是工伤职工因工作受伤后，为了恢复健康而必须支付的费用，这部分费用应当由工伤保险基金或者用人单位（在未参加工伤保险的情况下）承担。
- 工伤赔偿是对工伤职工因工作受伤而遭受的损失和痛苦的补偿，它涵盖了多个方面，包括但不限于医疗费。因此，治疗费作为工伤赔偿的一部分，不应当被单独扣除。
公司的做法是否合理：
- 公司将治疗费从工伤赔偿中扣除的做法，实际上是在试图减轻自己的赔偿责任，这违反了工伤保险制度的原则和目的。
- 工伤保险制度是为了保障工伤职工的合法权益，确保他们在因工作受伤后能够得到及时、有效的治疗和经济补偿。公司的做法违背了这一制度的精神。
法律建议：
与公司沟通：
- 首先，你可以尝试与公司进行沟通，明确表达你的观点和诉求，即治疗费应当作为工伤赔偿的一部分，不应当被扣除。
- 在沟通过程中，你可以引用相关的法律法规和政策，以增强你的说服力。
申请劳动仲裁或提起诉讼：
- 如果与公司沟通无果，你可以考虑向当地的劳动仲裁机构申请劳动仲裁，或者向人民法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。
- 在申请劳动仲裁或提起诉讼时，你需要提供相关的证据材料，如工伤认定书、医疗费用发票、工伤赔偿协议等，以证明你的诉求是合理和合法的。
咨询专业律师：
- 如果你对法律程序或相关法律法规不太了解，可以寻求专业律师的帮助。作为专注于合同纠纷、劳动纠纷领域的律师，我可以为你提供专业的法律咨询和代理服务。
可能的法律后果：
- 如果公司坚持将治疗费从工伤赔偿中扣除，并且这一行为被认定为违法，那么公司可能需要承担相应的法律责任，包括支付被扣除的治疗费、赔偿因违法行为给工伤职工造成的损失等。
- 同时，公司的这一行为也可能对其声誉和信誉造成负面影响，影响其与员工的关系和未来的业务发展。
总结与进一步思考：
- 工伤赔偿是保障工伤职工合法权益的重要制度，公司应当严格遵守相关法律法规和政策，确保工伤职工能够得到及时、有效的治疗和经济补偿。
- 作为工伤职工，你也应当了解自己的权益和义务，积极维护自己的合法权益。如果遇到公司违法扣除治疗费等类似情况，不要犹豫，及时寻求法律帮助。
- 如果你还有其他关于工伤赔偿或劳动纠纷的问题，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律解答和建议。