结论前置：针对已在劳动仲裁且未到公司上班的人员，公司停交社保的申请需谨慎处理，一般需结合具体情况撰写申请，以下提供通用模板及注意事项。

1. 通用申请模板

标题：关于停缴[员工姓名]社会保险的申请

致：[社保经办机构名称]

内容：

我司[公司名称]，统一社会信用代码[公司统一社会信用代码]，现就员工[员工姓名]，身份证号[员工身份证号]，因[具体原因，如“长期旷工且已提起劳动仲裁”]，自[具体日期]起未到公司上班，且我司已就与其的劳动争议向[劳动仲裁委员会名称]提起仲裁申请（仲裁申请编号：[仲裁申请编号]）。

鉴于上述情况，为避免公司承担不必要的社保费用支出，同时遵循相关法律法规的规定，我司特此申请自[停缴起始日期，建议为仲裁裁决生效后或双方劳动关系实际解除之日起]停缴该员工的社会保险（包括养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险、生育保险）。

请贵机构予以审核并办理相关停缴手续。如有需要，我司愿提供进一步的相关证明材料。

此致 敬礼！

[公司名称]（盖章） [申请日期]

2. 注意事项

• 劳动关系确认：在申请停缴社保前，公司应确保与该员工的劳动关系已经依法解除或确认解除。若劳动仲裁尚未裁决，公司一般不宜单方面停缴社保，除非能证明员工存在严重违反公司规章制度等法定解除情形，且已履行了相应的解除程序。
• 证据准备：公司应准备好与停缴社保相关的证据材料，如员工旷工记录、公司规章制度、劳动仲裁申请书及受理通知书等，以备社保经办机构审核。
• 沟通协商：在可能的情况下，公司应与员工进行沟通协商，尽量达成一致意见后再办理停缴手续，以减少不必要的纠纷。
• 及时办理：一旦确认劳动关系解除或仲裁裁决生效，公司应及时向社保经办机构提交停缴申请，避免产生不必要的社保费用。

3. 特殊情况处理

• 若劳动仲裁裁决员工胜诉：公司需按照裁决结果继续履行社保缴纳义务，直至双方劳动关系依法解除或终止。
• 若员工提出异议：公司应积极应对员工的异议，必要时可寻求法律援助或咨询专业律师，以确保公司权益不受损害。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。