双方约定合同仅用于开票，合同效力需分情况讨论，具体如下：

1. 合同内容合法且不违背公序良俗时有效
   若合同仅约定“双方签订本合同的目的仅为开具发票”，且合同其他条款（如标的、价款、履行方式等）均符合《民法典》第143条规定的民事法律行为有效要件（行为人具有相应民事行为能力、意思表示真实、不违反法律或行政法规的强制性规定、不违背公序良俗），则该合同有效。例如：甲乙双方签订《服务合同》，约定甲为乙提供咨询服务，乙支付价款，同时明确“本合同仅用于乙向税务机关开具发票”，此类约定属于双方对合同用途的补充说明，不影响合同整体效力。

2. 合同以合法形式掩盖非法目的时无效
   若合同表面约定“仅用于开票”，但实际目的是通过虚构交易、虚开发票等方式逃避税收监管或套取资金，则属于《民法典》第154条规定的“恶意串通，损害他人合法权益”或第153条规定的“违反法律、行政法规的强制性规定”的情形，合同无效。例如：甲乙双方无真实交易，签订《购销合同》仅为了开具增值税专用发票供乙抵扣税款，此类合同因违反《税收征收管理法》第63条关于偷税的规定而无效，且可能面临行政处罚甚至刑事责任。

实务建议：

• 若需明确合同用途，建议在合同中完整描述交易背景（如“本合同系双方就XX服务达成的真实交易，开具发票仅为履行纳税义务”），避免单独使用“仅用于开票”等模糊表述；
  
• 若涉及大额交易或复杂交易结构，建议提前咨询税务机关或律师，确保合同目的与实际履行一致，避免被认定为“虚开发票”。
  

如有具体合同条款或交易场景需要分析，可直接向我提供细节，我会结合法律规定进一步解答。