借调干部在借调期间违纪的处理单位，主要取决于借调协议的具体约定以及违纪行为的性质和严重程度，但通常情况下，会由原单位或借调单位根据实际情况进行处理。以下从不同角度进行详细分析：
借调协议约定优先：
- 在借调关系中，原单位与借调单位通常会签订借调协议，明确双方的权利和义务，包括借调干部的管理、违纪处理等事项。
- 如果借调协议中明确规定了借调干部在借调期间违纪的处理单位，那么应当遵循协议的约定进行处理。例如，协议可能规定由借调单位负责日常管理并处理违纪行为，或者由原单位负责处理但需借调单位提供协助等。
无约定或约定不明时的处理：
- 如果借调协议中没有明确规定违纪的处理单位，或者规定不明确，那么通常需要根据实际情况进行判断。
- 一般来说，如果违纪行为发生在借调单位的工作场所或与借调工作相关，且借调单位对借调干部有直接的管理权，那么借调单位可能会承担主要处理责任。借调单位可以依据其内部的规章制度对借调干部进行纪律处分，如警告、记过、解除借调关系等。
- 同时，原单位作为借调干部的正式用人单位，也有权对借调干部的违纪行为进行监督和处理。原单位可以要求借调单位提供违纪情况的相关证据，并根据证据情况对借调干部进行相应的纪律处分，如警告、记过、解除劳动合同等。
违纪行为的性质和严重程度：
- 违纪行为的性质和严重程度也是影响处理单位的重要因素。如果违纪行为轻微，且不影响借调工作的正常进行，那么可能由借调单位进行内部处理即可。
- 如果违纪行为严重，如涉及违法犯罪、严重违反职业道德等，那么可能需要原单位和借调单位共同介入处理，甚至可能需要移交司法机关处理。
建议：
- 对于借调干部而言，在借调期间应严格遵守借调单位和原单位的规章制度，避免发生违纪行为。
- 对于原单位和借调单位而言，应在借调协议中明确约定违纪的处理单位和处理方式，以避免发生纠纷时无法明确责任。
- 如果发生违纪行为，双方应积极沟通、协商处理，确保违纪行为得到妥善处理，同时维护借调关系的稳定和和谐。
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