农业用地原则上不能擅自建小作坊，但符合特定条件并履行审批手续的除外。具体分析如下：

1. 法律对农业用地用途的严格限制
   根据《土地管理法》第四条，国家实行土地用途管制制度，将土地分为农用地、建设用地和未利用地。农业用地（如耕地、林地、草地等）的用途受严格保护，未经依法批准不得擅自改变用途。若直接在农业用地上建设小作坊（属于非农业建设行为），可能涉嫌违反《土地管理法》第七十七条，面临责令退还土地、限期拆除建筑物、罚款等行政处罚。

2. 例外情形：符合规划并履行审批手续
   若小作坊属于农村一二三产业融合发展项目（如农产品初加工、乡村旅游配套设施等），且符合以下条件，可依法申请用地：

   • 符合土地利用总体规划：项目需纳入县级或乡镇级土地利用总体规划；
     
   • 办理农用地转用审批：需向县级以上人民政府自然资源主管部门申请，将农业用地转为建设用地；
     
   • 符合产业政策：需符合当地乡村振兴、产业布局等政策要求；
     
   • 环保与安全合规：需通过环境影响评价、安全生产评估等程序。
     例如，某地允许在符合规划的集体建设用地上建设农产品加工坊，但需经村民会议同意并报乡镇政府批准。

3. 实践中的风险与建议

   • 风险点：未履行审批手续擅自建设，可能被认定为违法用地，面临强制拆除、罚款，甚至影响企业信用记录；
     
   • 建议：
     
     1. 提前咨询当地自然资源部门，确认土地性质及规划用途；
        
     2. 若需改变用途，依法申请农用地转用或使用集体建设用地；
        
     3. 优先选择已有建设用地的厂房，或通过租赁、合作方式利用闲置农房、宅基地（需符合“一户一宅”政策）。

总结：农业用地建小作坊需以“不改变土地性质”为前提，若涉及非农建设，必须严格履行审批程序。建议根据项目性质、用地规划及地方政策，提前规划合规路径，避免法律风险。如有具体案例或地方政策疑问，可进一步向我咨询。