设施农业用地一般不能直接用于建设与农业生产关联不大的工厂，但可用于建设与农业生产直接相关的加工设施，不过必须依法办理农用地转用审批手续。以下是对此问题的详细分析：

一、设施农业用地的定义与用途

设施农业用地主要包括农业生产中直接用于作物种植和畜禽水产养殖的设施用地，以及配套设施用地。配套设施用地是指由农业专业大户、家庭农场、农民合作社、农业企业等从事规模化粮食生产所必需的配套设施用地，如晾晒场、粮食烘干设施、粮食和农资临时存放场所、大型农机具临时存放场所等。这些设施用地的主要目的是支持农业生产，完善农业产业链。

二、设施农业用地建工厂的条件

1. 与农业生产直接相关：

   • 如果工厂是用于农产品加工、储存等与农业生产直接相关的活动，且符合相关规划和审批要求，那么是有可能被允许在设施农业用地上建设的。例如，建设冷库和初级加工厂（如分拣、包装等简单加工处理）通常被视为农业生产链条中的必要环节，其建设用地可能受到政策支持。

2. 依法办理审批手续：

   • 无论工厂用途如何，都必须在设施农业用地上建设前依法办理农用地转用审批手续。这是为了规范土地用途的变更，确保土地管理秩序，使土地使用在合法合规的轨道上进行。未经审批擅自改变土地用途，可能面临土地被责令恢复原状、罚款等处罚，情节严重的，相关责任人还可能承担法律责任。

三、设施农业用地违规建工厂的后果

如果未经审批擅自将设施农业用地用于建设与农业生产关联不大的工厂，改变了土地用途，将违反土地管理相关法律法规。相关部门有权责令违法者在规定期限内拆除违规建筑，恢复土地原状，并可能并处罚款。若情节严重，还可能触犯非法占用农用地罪，根据《刑法》规定，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。

四、建议与注意事项

1. 明确工厂用途：

   • 在决定是否在设施农业用地上建设工厂前，必须明确工厂的用途。如果工厂与农业生产无直接关联，如用于生产非农产品的工业产品，那么通常不可以在设施农业用地上建设。

2. 咨询当地政策：

   • 不同地区对于设施农业用地的管理和审批要求可能存在差异。因此，在决定建设工厂前，建议咨询当地土地管理部门或农业部门，了解具体的政策和审批流程。

3. 依法办理审批手续：

   • 如果决定在设施农业用地上建设工厂，必须依法办理农用地转用审批手续。这包括向当地乡镇政府或相关部门提交设施农业用地建设申请，包括项目名称、建设地点、用地规模、建设内容等信息，并经过审核备案、签订协议等步骤。

作为专业律师，我建议你在进行此类土地利用活动时务必谨慎，确保依法依规进行。如果你有任何关于设施农业用地或相关法律问题的疑问，可以直接向我咨询。