针对您提出的“工伤九级上班两年后辞职能拿到哪些赔偿，以及具体怎么计算和申请”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

一、核心赔偿项目及计算方式

1. 一次性伤残补助金

   • 标准：9个月的本人工资（工伤前12个月的平均月缴费工资）。
   • 支付方：工伤保险基金。
   • 说明：此补助金在工伤认定及劳动能力鉴定完成后即可获得，不依赖于职工是否辞职。

2. 一次性工伤医疗补助金

   • 标准：具体数额由省、自治区、直辖市人民政府规定，通常与职工的平均工资和工伤保险缴费基数相关。例如，某些地区可能规定为2个月的本人工资。
   • 支付方：工伤保险基金。
   • 条件：在劳动或聘用合同期满终止，或者职工主动提出解除合同时支付。

3. 一次性伤残就业补助金

   • 标准：由地方政府具体规定，考虑因素包括职工所在地的平均工资等。例如，某些地区可能规定为8个月的本人工资。
   • 支付方：用人单位。
   • 条件：与一次性工伤医疗补助金相同，即合同终止或职工提出解除合同时。

二、其他相关待遇

• 停工留薪期工资：在您因工受伤需要暂停工作接受治疗期间，原工资待遇不变，由单位按月支付。期限一般不超过12个月，特殊情况下可适当延长。
• 医疗费用：符合规定的工伤治疗费用，包括诊疗费、药品费、住院服务费等，已由工伤保险基金支付（若单位未缴纳工伤保险，则由单位承担）。
• 护理费、伙食补助费、交通食宿费等：根据实际发生的合理费用，按照相关规定进行报销或支付（这些费用通常在工伤治疗期间已经处理）。

三、申请流程

1. 工伤认定与劳动能力鉴定

   • 确保您已经完成了工伤认定和劳动能力鉴定，并获得了相应的认定书和鉴定结论书。

2. 辞职手续

   • 按照公司规定的离职流程办理辞职手续，并获取离职证明。

3. 申请赔偿

   • 一次性伤残就业补助金：向用人单位提交工伤认定决定书、劳动能力鉴定结论书、离职证明等材料，申请一次性伤残就业补助金。
   • 一次性工伤医疗补助金：向当地的工伤保险基金提交申请表及相关材料（如工伤认定决定书、劳动能力鉴定结论书、身份证等），申请一次性工伤医疗补助金。

四、可能遇到的问题及解决办法

1. 用人单位拒绝支付一次性伤残就业补助金

   • 首先尝试与用人单位协商解决，明确法律责任。
   • 若协商不成，可向当地劳动仲裁委员会申请劳动仲裁，通过法律途径维权。
   • 对仲裁结果不服，可向人民法院提起诉讼。

2. 工伤保险基金支付问题

   • 如遇材料不齐全或审核不通过，应咨询工伤保险经办机构，了解原因并按要求补充或修改材料。

五、额外建议

• 在辞职前，仔细考虑并权衡利弊，确保辞职是您的最佳选择。
• 确保所有相关医疗文件和工伤认定证明齐全，以便在需要时提供证明。
• 详细咨询当地的劳动法律专业人士或社保机构，以了解具体权益和操作流程，确保您的权益得到充分保障。

综上所述，工伤九级员工在辞职时享有明确的补偿权益，包括一次性伤残补助金（虽已获得，但仍是赔偿体系的一部分）、一次性工伤医疗补助金和一次性伤残就业补助金。通过遵循正确的申请流程和妥善应对可能遇到的问题，您可以确保这些权益得到有效保障。