针对您提出的“员工私拿公款2000元起诉怎么处理”的问题，这确实是一个涉及法律与单位内部管理的重要议题。以下是我根据相关法律法规及实践经验，为您提供的详细分析与处理建议：
一、法律层面分析
非国家工作人员身份且挪用私营企业等非国有单位资金：
- 根据我国相关法律规定，挪用资金罪的“数额较大”起点通常为10万元。因此，员工挪用2000元并未达到刑事立案的标准，不构成挪用资金罪。
- 尽管如此，该行为仍然违反了单位的规章制度和员工应尽的忠诚义务。单位有权依据内部规章制度，要求员工返还挪用的公款，并可给予相应的纪律处分，如警告、记过、降职等。
- 若员工拒绝返还，单位可以通过民事诉讼途径追讨款项，以维护单位的财产权益。
国家工作人员身份且挪用国有单位资金：
- 对于国家工作人员而言，挪用公款归个人使用进行非法活动，数额需达到三万元以上，或挪用公款进行营利活动、超过三个月未还且数额在五万元以上，才构成挪用公款罪。因此，挪用2000元同样不构成此罪。
- 但该行为违反了国家的法律法规，根据相关政务处分规定，国家工作人员可能面临警告、记过、记大过、降级、撤职等政务处分，并被要求及时返还款项。
二、单位内部处理建议
立即进行内部调查：
- 单位应迅速组织相关部门进行内部调查，核实情况并收集证据，确保事实清楚、证据确凿。这是后续处理的基础和前提。
与员工进行面谈：
- 在掌握充分证据后，单位应与员工进行面谈，了解其挪用公款的具体原因、动机及款项去向。同时，明确告知其行为的严重性和可能面临的后果，引导其认识错误并主动返还公款。
依据规章制度给予纪律处分：
- 根据单位内部规章制度，对挪用公款的员工给予相应的纪律处分。处分应公正、合理，既体现对违规行为的惩戒，又考虑员工的实际情况和改正态度。
加强内部控制与财务管理：
- 此次事件应作为单位加强内部控制和财务管理的契机。单位应完善财务管理制度，特别是审批流程和内部审计机制，以预防类似事件再次发生。
三、考虑法律途径的必要性
- 虽然2000元金额相对较小，但若单位认为有必要追究员工的法律责任以维护单位秩序和权益时，仍可向公安机关报案。不过，在决定是否采取法律手段时，单位需综合考虑案件性质、影响及员工个人情况等因素，确保处理方式的合理性和有效性。
四、综合处理原则与预防措施
- 统一处理原则：不论员工身份如何，挪用公款都是违反职业道德和单位规章制度的行为。单位应严肃对待，及时采取措施处理，确保程序合法、公正透明。
- 法律教育与预防：通过此次事件加强对全体员工的法制教育和职业道德培训，提升员工的法律意识和职业操守。同时，完善单位内部控制制度，强化财务监管和风险防控机制，构建长效防范体系。
综上所述，对于员工私拿公款2000元的行为，虽然不构成犯罪，但仍需依法依规进行处理。单位应通过上述措施确保资金安全、维护正常秩序，并促进员工的廉洁自律和职业发展。希望这些建议能对您有所帮助。