结论：公司在月底最后一天通知解除合同，且员工年休假未休的情况下，公司应补偿员工3倍工资，但其中已包含公司已支付的一倍正常工资，实际需额外支付2倍工资的差额。

法律背景与解释：

1. 年休假补偿规定：

   • 根据《职工带薪年休假条例》第五条，单位确因工作需要不能安排职工休年休假的，经职工本人同意，可以不安排职工休年休假。对职工应休未休的年休假天数，单位应当按照该职工日工资收入的300%支付年休假工资报酬，其中包含用人单位支付职工正常工作期间的工资收入。

2. 解除合同与年休假补偿的关系：

   • 当公司在月底最后一天通知解除合同时，如果员工还有未休的年休假，公司应当按照上述规定支付年休假工资报酬。
   • 这里的“300%”支付，实际上是指员工在未休年休假期间应得的工资总额，包括正常工作期间的工资（即100%）和额外的200%补偿。由于公司已经支付了正常工作期间的工资，因此实际需额外支付的是200%的差额。

3. 实际操作中的注意事项：

   • 公司应确保在解除合同前，已经与员工就未休年休假的补偿事宜进行了充分沟通，并达成一致意见。
   • 如果员工对年休假补偿有异议，公司应提供相应的证据（如考勤记录、工资单等）来证明其已经按照法律规定支付了年休假工资报酬。
   • 如果公司未按照法律规定支付年休假工资报酬，员工有权向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，要求公司支付相应的补偿。

建议：

• 对于公司而言，建议在解除合同前，仔细审查员工的年休假情况，确保按照法律规定支付年休假工资报酬，以避免不必要的法律纠纷。
• 对于员工而言，如果发现公司未按照法律规定支付年休假工资报酬，应及时与公司沟通协商，或向劳动监察部门投诉、提起劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

示例说明：

假设员工的日工资为500元，未休年休假为5天。那么，公司应支付的年休假工资报酬总额为：500元/天 × 5天 × 300% = 7500元。其中，公司已经支付了正常工作期间的工资500元/天 × 5天 = 2500元，因此实际需额外支付的差额为7500元 - 2500元 = 5000元，即相当于额外支付了2倍工资的差额（500元/天 × 5天 × 200% = 5000元）。