结论：签订项目制劳动合同，项目自然结束时，是否需要支付赔偿，这主要取决于劳动合同的具体约定以及项目结束的原因是否符合法定或约定的解除条件。以下从不同角度进行分析：
一、劳动合同的具体约定
合同中有明确约定：
- 如果劳动合同中明确约定了项目结束时，无论何种原因，用人单位均需支付一定的经济补偿或赔偿金，那么用人单位应当按照合同约定履行支付义务。
- 反之，如果合同中没有相关约定，或者约定了项目自然结束时无需支付赔偿，那么用人单位可能无需支付。
合同约定不明确或存在争议：
- 当合同中的相关条款存在模糊或争议时，需要依据《劳动合同法》等相关法律法规进行解释和判断。
- 此时，可能需要通过劳动仲裁或诉讼等法律途径来解决争议。
二、项目结束的原因及法定解除条件
项目自然结束且符合法定解除条件：
- 如果项目因正常完成、不可抗力等原因自然结束，且符合《劳动合同法》中规定的劳动合同解除条件（如劳动合同期满、用人单位被依法宣告破产等），那么用人单位可能无需支付额外的赔偿金。
- 但在此情况下，如果劳动者因项目结束而失业，且符合领取失业保险金的条件，可以依法申请领取失业保险金。
项目结束但不符合法定解除条件：
- 如果项目结束并非由于正常完成或不可抗力等原因，而是由于用人单位的违法行为（如违法解除劳动合同）导致，那么劳动者有权要求用人单位支付赔偿金。
- 赔偿金的数额通常根据劳动者在用人单位的工作年限、工资水平等因素确定，具体依据《劳动合同法》的相关规定。
三、实际操作建议
审查劳动合同：
- 劳动者应仔细审查与用人单位签订的劳动合同，特别是关于项目结束时的经济补偿或赔偿金的约定。
- 如果合同中有相关约定，应确保自己了解并同意这些条款。
保留证据：
- 在项目进行过程中，劳动者应保留与项目相关的所有证据，包括但不限于项目合同、工作记录、沟通记录等。
- 这些证据在后续可能发生的劳动争议中可能起到关键作用。
寻求法律帮助：
- 如果劳动者对项目结束时的经济补偿或赔偿金有疑问或争议，可以寻求专业律师的法律帮助。
- 律师可以根据具体情况提供法律意见，并帮助劳动者维护自己的合法权益。
进一步思考：在实际操作中，项目制劳动合同的解除和赔偿问题可能因具体情况而异。因此，劳动者在签订劳动合同时应尽可能明确约定项目结束时的相关事宜，以避免后续争议。同时，用人单位也应遵守相关法律法规，确保劳动合同的合法性和有效性。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。