耕田上的建筑移交农业农村局后，农业农村局会根据建筑性质、用途及是否符合相关规划要求，采取不同的处理方式。具体来说，可能包括以下几种情况：

1. 若建筑符合农业用途规划：

   • 合法保留并利用：如果耕田上的建筑原本就是用于农业生产、储存或相关配套服务，且符合当地农业发展规划和土地利用规划，农业农村局可能会允许该建筑继续保留并用于农业用途。这种情况下，建筑的所有者或使用者可能需要按照相关规定办理或完善相关手续，如农业设施用地备案等。
   • 规范管理：农业农村局可能会对该建筑进行规范管理，确保其符合农业生产的需要，同时防止其被用于非农业用途。

2. 若建筑不符合农业用途规划或存在违法建设：

   • 责令整改或拆除：如果耕田上的建筑违反了土地利用规划、农业发展规划或相关法律法规，农业农村局有权责令建筑的所有者或使用者进行整改，甚至拆除违法建筑。整改或拆除的期限和方式将根据具体情况由农业农村局决定。
   • 处罚措施：对于违法建设行为，农业农村局还可能依法对建筑的所有者或使用者进行处罚，包括罚款、没收违法所得等。

3. 若建筑涉及土地性质变更：

   • 依法处理土地变更事宜：如果耕田上的建筑涉及土地性质从农用地变更为建设用地，这需要经过严格的法律程序和审批。农业农村局在接收到此类建筑后，会依法处理土地变更事宜，包括要求建筑所有者或使用者补办土地变更手续、缴纳相关税费等。
   • 恢复土地原状：如果土地变更未经批准或不符合相关规定，农业农村局有权要求恢复土地原状，即拆除建筑并恢复为耕田。

建议：

• 如果您是耕田上建筑的所有者或使用者，建议您在移交前仔细了解相关法律法规和政策要求，确保建筑符合农业用途规划和土地利用规划。
• 如果建筑存在违法建设或土地变更未经批准的情况，建议您尽快与农业农村局沟通并主动整改，以避免可能的法律后果。
• 在整个过程中，如果您有任何疑问或需要法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。