结论：若您已提交辞职申请书但公司不让辞职，您可以根据具体情况采取以下措施来维护自己的合法权益。
分析说明：
确认辞职申请书的法律效力：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十七条，劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。这意味着，一旦您以书面形式提交了辞职申请，并且满足了提前三十日通知的条件，您就有权解除劳动合同，公司无权阻止。
与公司沟通协商：
- 在确认辞职申请书的法律效力后，您可以首先尝试与公司进行沟通协商，了解公司不让辞职的具体原因，并尝试解决可能的误解或问题。如果公司提出合理的解决方案，如寻找替代人员、完成交接工作等，您可以考虑配合公司完成相关流程。
保留证据并准备法律途径：
- 如果公司无正当理由拒绝您的辞职申请，或者拖延办理离职手续，您应当保留好辞职申请书、与公司沟通的记录等证据。这些证据在后续可能的法律纠纷中将成为关键。
- 您可以向当地劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁，要求公司确认您的辞职行为有效，并办理离职手续。在劳动仲裁过程中，您需要提供充分的证据来支持自己的主张。
注意离职后的权益保障：
- 在离职过程中，您还需要注意保障自己的其他权益，如工资结算、经济补偿（如果适用）、社保转移等。如果公司存在拖欠工资、未支付经济补偿等违法行为，您同样可以通过法律途径来维护自己的权益。
行动建议：
- 再次确认辞职申请书：确保您的辞职申请书已经以书面形式提交，并且满足了提前三十日通知的条件。
- 与公司沟通：尝试与公司进行友好沟通，了解公司不让辞职的具体原因，并寻求解决方案。
- 保留证据：保留好辞职申请书、与公司沟通的记录等证据，以备后续法律纠纷之需。
- 寻求法律帮助：如果公司无正当理由拒绝您的辞职申请或拖延办理离职手续，您可以考虑向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。在此过程中，如有需要，您可以随时向我咨询相关法律问题。
后续思考依据：
- 在处理此类劳动纠纷时，关键在于确认辞职申请书的法律效力和保留好相关证据。只有确保了自己的辞职行为符合法律规定，并且有了充分的证据支持，才能在后续的法律纠纷中占据有利地位。
- 同时，与公司进行友好沟通也是解决纠纷的重要途径。通过沟通，可以了解公司的立场和需求，从而寻求双方都能接受的解决方案。如果沟通无果，再考虑采取法律途径来维护自己的权益。