结论：建设工程合同无效时，能否主张按实结算需根据工程质量、合同约定及实际情况综合判定。若工程经竣工验收合格，承包人有权请求参照合同约定支付工程价款；若不合格，则需根据修复情况及双方约定处理。在无约定或约定不明时，可参照市场价格或进行鉴定评估。

一、工程质量合格时的结算

1. 参照合同约定结算

   • 根据《中华人民共和国民法典》第七百九十三条，建设工程施工合同无效，但建设工程经验收合格的，可以参照合同关于工程价款的约定折价补偿承包人。这一原则体现了对承包人实际投入和建设成果的尊重。
   • 实例说明：如甲建筑公司与乙开发商签订的建设工程施工合同虽被认定无效，但工程经竣工验收合格，甲公司有权按合同约定要求乙开发商支付工程款。

2. 根据实际履行情况调整

   • 若实际履行与合同约定存在差异，如工程变更、材料替换等，应据实调整工程款。这要求双方在合同履行过程中保持沟通，及时记录变更情况，以便在结算时提供依据。
   • 实例说明：如因设计变更导致工程量增加，应按实际完成量结合合同单价计算工程款。若合同未约定单价，则可参照市场价格或进行鉴定评估。

二、工程质量不合格时的结算

1. 修复后合格

   • 工程验收不合格但经修复后合格的，发包人可要求承包人承担修复费用，并从工程款中扣除。这要求承包人在修复过程中保留相关证据，以便在结算时证明修复费用的合理性。
   • 实例说明：如某工程部分施工不符标准，经验收不合格后，承包人进行修复并再次验收合格。发包人可扣除修复费用后支付剩余工程款。

2. 修复后仍不合格

   • 若工程经修复后仍不合格，承包人无权请求支付工程价款，并可能需赔偿发包人因此遭受的损失。这要求承包人在施工过程中严格把控质量，避免因质量问题导致无法获得工程款。
   • 实例说明：如基础施工存在严重质量问题，修复后仍不合格。承包人不仅无法获得工程款，还需赔偿发包人因工程不合格导致的损失。

三、没有约定或约定不明时的结算

1. 参照市场价格

   • 合同无效且双方对工程价款无约定或约定不明时，可参照签订合同时当地建设行政主管部门发布的计价方法或标准结算。这要求双方在签订合同时了解当地计价方法或标准，以便在结算时提供参考。
   • 实例说明：如小型工程中双方仅口头约定工程价款，发生纠纷时可参照当地计价方法确定工程款。

2. 鉴定评估

   • 若无法通过上述方法确定工程款，可通过鉴定评估确定数额。鉴定机构会考虑工程成本、市场行情等因素作出合理结论。这要求双方在鉴定评估过程中积极配合，提供相关证据和资料。
   • 实例说明：如特殊工程无法适用现有计价方法，可委托专业鉴定机构进行评估。鉴定机构将根据工程实际情况和市场行情等因素确定工程款数额。

四、处理建议与注意事项

1. 确定工程质量：首要任务是确保工程质量符合标准，以作为结算依据。这要求双方在施工过程中加强质量监管和验收工作。
2. 协商与调解：双方应尽量通过协商和调解解决争议，避免法律纠纷。这有助于维护双方合作关系和降低解决争议的成本。
3. 保留证据：无论是协商还是诉讼，都应妥善保管相关文件和资料作为证据。这有助于在结算时证明自己的权益和主张。
4. 了解法律法规：熟悉相关法律法规和政策规定，以更好地维护自身权益并规避法律风险。这要求双方在签订合同和履行合同过程中了解相关法律法规和政策规定。
5. 诉诸法律途径：若无法达成一致意见，可通过法律途径解决争议，如向人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，双方应积极配合法院工作，提供相关证据和资料。

总结：建设工程合同无效时的工程款结算问题需综合考虑工程质量、合同约定及实际情况等多方面因素。双方应保持冷静理性，通过协商、调解或法律途径解决争议，并确保工程款的合理支付。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。