合同制职工除名是否需记入档案，需分情况讨论，具体如下：

1. 若除名决定合法且程序正当
   根据《企业职工档案管理工作规定》及《劳动合同法》相关规定，用人单位对职工的处分材料（包括除名决定）属于档案必备内容。若除名决定基于合法理由（如严重违反规章制度、被依法追究刑事责任等），且履行了法定程序（如提前告知、听取申辩、工会参与等），则必须将除名决定及相关证明材料（如违纪证据、会议纪要等）归入职工档案。这是用人单位的法定义务，也是职工劳动关系变更的法定证明。

2. 若除名决定违法或程序瑕疵
   若除名决定缺乏事实依据（如虚构违纪事实）、违反法定程序（如未通知工会、未给予申辩机会）或适用法律错误（如以轻微违纪为由直接除名），则该决定可能被劳动仲裁或法院撤销。此时，用人单位不仅需承担违法解除的赔偿责任（如支付赔偿金），还必须及时修正档案内容——必须从档案中移除违法除名记录，并恢复职工原档案状态。若用人单位拒不改正，职工可依据《企业职工档案管理工作规定》向劳动行政部门投诉，或通过诉讼要求用人单位履行档案修正义务。

实务建议：

• 对用人单位而言，除名决定需严格遵循“事实清楚、证据充分、程序合法”原则，并留存完整书面材料（如违纪通知、职工签字确认的处罚决定等），避免因程序瑕疵导致档案记录无效。
  
• 对职工而言，若发现档案中存在违法除名记录，可先与用人单位协商要求修正；协商无果的，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，同时可要求用人单位出具书面《档案修正通知书》作为后续维权依据。
  

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