在合伙关系中，若其中一人向法院起诉工程款，而另一人被列为第三人，第三人可以通过以下方式主张自己的权利：

1. 明确第三人地位及权利基础：

   • 作为第三人，你首先需要明确自己在该诉讼中的法律地位。第三人通常分为有独立请求权的第三人和无独立请求权的第三人。在工程款纠纷中，若你对工程款有独立的请求权（例如，你认为自己也是工程款的合法受益人或应分担部分责任），则你属于有独立请求权的第三人；若你与案件处理结果有法律上的利害关系，但无独立请求权，则属于无独立请求权的第三人。
   • 无论哪种情况，你都应仔细研究起诉状、证据材料等，了解案件的基本事实和争议焦点，以便更好地主张自己的权利。

2. 提出独立的诉讼请求或抗辩：

   • 有独立请求权的第三人：你可以向法院提出独立的诉讼请求，要求法院确认你对工程款的权利或份额，或者要求法院驳回原告的诉讼请求（如果认为原告无权获得工程款）。在提出诉讼请求时，你需要提供充分的证据来支持你的主张，如合伙协议、工程款支付记录、工程完成情况等。
   • 无独立请求权的第三人：你可以提出抗辩，说明自己与案件处理结果的关系，以及为何不应承担原告所主张的责任。例如，你可以提出工程款已全部支付给原告，或者原告所主张的工程款中包含了不应由你承担的部分等。

3. 参与庭审并充分发表意见：

   • 在庭审过程中，你有权参与法庭调查、法庭辩论等环节，充分发表自己的意见和看法。你可以对原告提出的证据进行质证，提出自己的反驳证据和理由，以维护自己的合法权益。
   • 同时，你也应尊重法庭的审理程序，遵守法庭纪律，不得干扰庭审的正常进行。

4. 申请法院调解或和解：

   • 在诉讼过程中，你可以与原告或其他当事人协商，尝试通过调解或和解的方式解决纠纷。调解或和解可以节省诉讼成本和时间，同时也有助于维护合伙关系或商业关系的和谐稳定。
   • 如果达成调解或和解协议，你可以要求法院制作调解书或和解协议书，以确认双方的权利义务关系。

5. 关注案件进展并适时采取法律措施：

   • 在诉讼过程中，你应密切关注案件的进展情况，及时了解法院的判决结果或调解协议内容。如果认为判决结果或调解协议侵犯了自己的合法权益，你可以在法定期限内提起上诉或申请再审。
   • 同时，你也可以根据案件的实际情况和需要，适时采取其他法律措施来维护自己的权益，如申请财产保全、申请强制执行等。

在具体操作中，第三人还需注意以下几点：

• 及时收集并保存证据：证据是主张权利的基础。第三人应尽早收集并保存与工程款纠纷相关的所有证据材料，如合伙协议、工程款支付记录、工程完成情况证明等。
• 咨询专业律师：虽然我是孙涛律师，但在此也建议第三人在处理此类纠纷时，最好咨询专业律师的意见。律师可以根据案件的具体情况和法律规定，为第三人提供专业的法律建议和帮助。
• 遵守法律程序：在诉讼过程中，第三人应严格遵守法律程序和规定，不得采取非法手段或行为来干扰诉讼的正常进行。否则，可能会面临法律制裁或不利后果。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。