针对您提出的问题，公司仅有两名员工，其中一名员工怀孕无法继续工作，公司可以采取以下措施：
了解怀孕员工的权益与公司的义务：
- 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国妇女权益保障法》等相关法律法规，怀孕员工享有特殊的劳动保护权益，如产假、哺乳假等，且在孕期、产期、哺乳期内，公司不得随意解除劳动合同。
- 公司应确保怀孕员工的工作环境安全，避免安排其从事可能危害胎儿健康的工作。
与怀孕员工进行沟通：
- 了解具体情况：与怀孕员工进行坦诚的沟通，了解她的身体状况、预产期以及她对于工作的期望和计划。
- 协商工作安排：根据怀孕员工的实际情况，协商调整她的工作岗位或工作内容，以确保她能够继续工作而不影响胎儿健康。例如，可以安排她从事一些相对轻松、不需要过多体力劳动的工作。
- 探讨休假安排：如果怀孕员工需要休息或准备分娩，公司应与她协商确定休假时间，并确保她能够享受到法定的产假和哺乳假等权益。
考虑公司运营与人员安排：
- 临时招聘或调配：如果怀孕员工的工作无法由另一名员工完全承担，公司可以考虑临时招聘一名新员工或从其他部门调配人员来填补空缺。
- 调整工作流程：重新评估公司的工作流程，看看是否可以通过优化或调整来减轻另一名员工的工作负担，或者提高工作效率以应对人员短缺的情况。
- 考虑外包或合作：对于某些非核心业务或临时性任务，公司可以考虑外包给其他专业机构或与其他公司合作完成，以减轻内部员工的工作压力。
关注法律风险与合规性：
- 确保合规操作：在处理怀孕员工的工作安排和休假等问题时，公司应确保所有操作都符合相关法律法规的要求，避免引发法律纠纷。
- 保留相关证据：与怀孕员工的沟通记录、工作安排调整通知、休假申请等文件都应妥善保存，以备不时之需。
提供必要的支持与帮助：
- 心理支持：怀孕员工可能会面临身体和心理上的双重压力，公司可以提供必要的心理支持或建议她寻求专业心理咨询。
- 物质帮助：如果条件允许，公司可以考虑为怀孕员工提供一些物质上的帮助，如购买孕妇用品、提供交通补贴等。
若公司在处理此类问题时遇到法律难题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。作为专业律师，我将根据您的具体情况提供针对性的法律解决方案。