结论：原公司被收购后，您在新公司工作三年是否有赔偿，这主要取决于收购的具体类型（资产收购还是股权收购）、劳动合同的变更情况以及收购协议中的相关约定。以下我将从不同角度为您详细分析。
一、收购类型的影响
股权收购：
- 在股权收购中，原公司的法人资格并未消灭，只是股东发生了变更。因此，原公司与您之间的劳动合同继续有效，新公司作为原公司的权利义务承受者，应继续履行原劳动合同。
- 这种情况下，您在新公司工作三年，如果没有发生劳动合同法规定的解除或终止情形，您是无权要求赔偿的。因为劳动合同并未因收购而解除或终止，您的劳动关系仍然存续。
资产收购：
- 在资产收购中，原公司可能将其主要资产（包括业务、员工等）转让给新公司，但原公司的法人资格仍然存在。此时，劳动合同的变更需要双方协商一致。
- 如果新公司同意接收您，并与您重新签订劳动合同或确认继续履行原劳动合同，那么您在新公司的工作年限应连续计算。同样，如果没有发生劳动合同法规定的解除或终止情形，您也是无权要求赔偿的。
- 但如果新公司不同意接收您，或者您不同意与新公司签订劳动合同，那么原公司可能需要按照劳动合同法规定向您支付经济补偿。经济补偿的计算公式为：每工作一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
二、劳动合同变更的影响
- 无论收购类型如何，如果劳动合同在收购过程中发生了变更（如工作岗位、工作地点、薪酬等），且这种变更未经您同意，您有权拒绝并要求按照原劳动合同继续履行。
- 如果因劳动合同变更导致您无法继续工作，且双方无法就变更达成一致，那么您可以视为原公司提出解除劳动合同，并要求原公司支付经济补偿。经济补偿的计算方式同上。
三、收购协议中的约定
- 收购协议中可能包含关于员工安置的条款，这些条款可能规定员工在新公司中的权益、工作年限的计算、经济补偿的支付等。
- 因此，您需要仔细审查收购协议中的相关条款，以确定自己在新公司中的权益和可能的赔偿情况。如果收购协议中有对您不利的条款，您可以尝试与新公司协商修改或寻求法律救济。
四、实际操作建议
- 收集证据：保留好与原公司和新公司之间的劳动合同、工资单、工作证明等证据，以备不时之需。
- 咨询专业意见：如果您对收购过程中的法律问题或自己的权益有疑问，建议及时咨询专业律师（当然，您可以直接向我咨询，我专注于公司事务和合同纠纷领域）。
- 协商解决：在可能的情况下，尝试与新公司协商解决争议，以达成双方都能接受的解决方案。
总结：原公司被收购后，您在新公司工作三年是否有赔偿，取决于收购类型、劳动合同的变更情况以及收购协议中的相关约定。建议您仔细审查相关文件，并咨询专业律师以获取更具体的法律建议。