结论：国有企业子公司普通职工借调到母公司后，在符合相关规定和程序的前提下，是可以担任母公司的科室负责人的。以下从多个角度进行分析：

1. 借调关系的本质：

   • 借调是用人单位之间因工作需要而进行的员工临时调配。在借调期间，员工的劳动关系通常仍保留在原单位（即子公司），但实际工作在另一单位（即母公司）进行。
   • 借调并不改变员工的劳动关系归属，但员工在借调期间需遵守借调单位的规章制度，并接受其管理。

2. 岗位任命与借调的关系：

   • 岗位任命是用人单位根据工作需要和员工能力，对员工进行的工作岗位安排。在借调期间，如果母公司认为借调员工具备担任科室负责人的能力和条件，且符合母公司的岗位任命规定和程序，那么是可以对其进行岗位任命的。
   • 需要注意的是，岗位任命应遵循公平、公正、公开的原则，并确保任命过程符合相关法律法规和公司章程的规定。

3. 相关法律法规和公司章程的考量：

   • 在进行岗位任命时，母公司应确保任命过程不违反国家法律法规的规定，如《公司法》、《劳动法》等相关法律法规中关于岗位任命、劳动关系等方面的规定。
   • 同时，母公司还应遵守其公司章程中关于岗位任命、员工管理等方面的规定。如果公司章程中有关于借调员工岗位任命的特别规定，那么应按照这些规定执行。

4. 实际操作中的注意事项：

   • 在进行岗位任命前，母公司应与子公司进行充分沟通，确保借调员工在借调期间的工作安排和岗位任命不会引发劳动争议或法律纠纷。
   • 母公司应对借调员工进行必要的考核和评估，确保其具备担任科室负责人的能力和条件。
   • 岗位任命后，母公司应与借调员工签订相关的岗位协议或补充协议，明确双方的权利和义务，以及借调期间的工作安排和薪酬待遇等事项。

建议：在实际操作中，如果母公司有意任命借调员工为科室负责人，建议先与子公司进行协商，并确保任命过程符合相关法律法规和公司章程的规定。同时，母公司还应加强对借调员工的管理和考核，确保其能够胜任新的工作岗位。如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。